More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1047 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  97.38 
 
 		 344 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 344 aa  669    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  72.67 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  68.73 
 
 		 344 aa  454  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  58.48 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  55.46 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  53.69 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  54.28 
 
 		 404 aa  355  7.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  53.39 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  52.8 
 
 		 383 aa  349  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  51.62 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  53.39 
 
 		 359 aa  344  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  51.76 
 
 		 362 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  52.21 
 
 		 381 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  53.09 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  53.98 
 
 		 377 aa  338  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  50.15 
 
 		 493 aa  335  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  49.85 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  51.03 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  51.63 
 
 		 354 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  50 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  47.79 
 
 		 368 aa  318  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  47.49 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  47.2 
 
 		 368 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  48.8 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  47.37 
 
 		 442 aa  306  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  46.63 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  47.08 
 
 		 442 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  45.86 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  44.11 
 
 		 475 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  45.72 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  44.71 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.61 
 
 		 536 aa  299  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  45.56 
 
 		 382 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  45.56 
 
 		 383 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 537 aa  297  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  46.15 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.71 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 537 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.41 
 
 		 535 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  45.56 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 		 538 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.41 
 
 		 534 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  44.31 
 
 		 531 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  43.71 
 
 		 538 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.11 
 
 		 552 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  44.97 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  45.27 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  48.98 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  45.51 
 
 		 506 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  44.41 
 
 		 433 aa  292  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  48.55 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  48.26 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  44.25 
 
 		 444 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  47.13 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  43.41 
 
 		 544 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  43.88 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  45.64 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  43.31 
 
 		 506 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  43.11 
 
 		 536 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  45.06 
 
 		 572 aa  289  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 406 aa  288  9e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  42.81 
 
 		 532 aa  288  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  43.15 
 
 		 537 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  45.17 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 537 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  46.15 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  43.45 
 
 		 539 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  43.11 
 
 		 545 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  43.15 
 
 		 541 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  45.51 
 
 		 516 aa  285  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  42.51 
 
 		 560 aa  285  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  44.21 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  46.18 
 
 		 491 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  43.15 
 
 		 540 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  42.56 
 
 		 536 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  48.81 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  42.56 
 
 		 538 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  41.92 
 
 		 545 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  41.92 
 
 		 545 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  46.18 
 
 		 491 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 		 537 aa  281  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  43.56 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  42.99 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  42.99 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  46.18 
 
 		 487 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  44.25 
 
 		 382 aa  279  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  40.22 
 
 		 556 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  45.93 
 
 		 534 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  41.72 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  44.13 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>