More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1943 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 366 aa  727    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  99.45 
 
 		 366 aa  724    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  63.01 
 
 		 346 aa  441  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  61.13 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  59.89 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  58.64 
 
 		 381 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  59.37 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  58.92 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  58.57 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  57.06 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  58.57 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  59.37 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  56.04 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  55.77 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  55.22 
 
 		 368 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  54.95 
 
 		 368 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  56.65 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  58.76 
 
 		 382 aa  401  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  59.2 
 
 		 377 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  56.32 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  51.64 
 
 		 378 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  56.2 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  52.54 
 
 		 433 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  53.2 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  52.89 
 
 		 407 aa  357  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  49.86 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  49.28 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  50.72 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  50.68 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  50.68 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  49.42 
 
 		 444 aa  348  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  47.54 
 
 		 491 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  46.84 
 
 		 491 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  48.69 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  47.25 
 
 		 487 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  47.21 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  47.4 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  47.69 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  47.69 
 
 		 382 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  46.53 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  46.69 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  45.92 
 
 		 406 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  45.71 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  46.24 
 
 		 369 aa  311  9e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  46.13 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  45.58 
 
 		 329 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  47.58 
 
 		 365 aa  308  6.999999999999999e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  45.24 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  46.06 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  45.32 
 
 		 401 aa  305  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  48.55 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  47.69 
 
 		 357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  45.11 
 
 		 449 aa  302  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  47.23 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  45.03 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  43.87 
 
 		 538 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  47.97 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  46.94 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.59 
 
 		 533 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  45.82 
 
 		 330 aa  299  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  42.62 
 
 		 506 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43.3 
 
 		 535 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.3 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  41.91 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  43.62 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  45.77 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.59 
 
 		 535 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  44.73 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 531 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.59 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.59 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  42.05 
 
 		 536 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  41.6 
 
 		 532 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 572 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  43.59 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  41.6 
 
 		 534 aa  290  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  44.77 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  44.44 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  41.26 
 
 		 429 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  44.85 
 
 		 348 aa  288  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  41.88 
 
 		 545 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  41.88 
 
 		 560 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  41.31 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  41.36 
 
 		 536 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  41.88 
 
 		 545 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  46.39 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0957  NusA antitermination factor  41.24 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  41.31 
 
 		 538 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  42.94 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  42.45 
 
 		 537 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 537 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  43.55 
 
 		 361 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>