More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1319 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 520 aa  1030    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  51.75 
 
 		 517 aa  491  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  52.14 
 
 		 517 aa  486  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  41.09 
 
 		 531 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  42.06 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  41.95 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  41.79 
 
 		 540 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  40.78 
 
 		 535 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  42.83 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  41.03 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  40.85 
 
 		 541 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  42.83 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 537 aa  389  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  40.15 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  42.55 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  39.88 
 
 		 538 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  40.81 
 
 		 536 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  40.19 
 
 		 534 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  39.88 
 
 		 552 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.3 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  42.55 
 
 		 544 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  38.83 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  42.13 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  42.98 
 
 		 538 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  41.18 
 
 		 560 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  38.83 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  41.76 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  42.13 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  41.39 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  39.22 
 
 		 532 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  39.69 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  40.13 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 538 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  41.26 
 
 		 536 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  40.24 
 
 		 559 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  42.18 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  40.84 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  39.91 
 
 		 533 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  42.37 
 
 		 523 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  35.12 
 
 		 590 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  39.41 
 
 		 548 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  37.77 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  41.03 
 
 		 529 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  35.66 
 
 		 495 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  36.28 
 
 		 537 aa  314  2.9999999999999996e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  36.56 
 
 		 498 aa  313  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  36.7 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  37.5 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  34.21 
 
 		 493 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  34.21 
 
 		 493 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 492 aa  300  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  35.47 
 
 		 499 aa  299  7e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  34.96 
 
 		 492 aa  299  9e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  36.5 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  35.41 
 
 		 503 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  35.41 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  35.42 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  35.42 
 
 		 501 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  35.08 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  35.64 
 
 		 494 aa  290  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 491 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  35.65 
 
 		 506 aa  290  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  34.91 
 
 		 499 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  40.2 
 
 		 406 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  35.23 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  35.21 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  34.64 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  35.51 
 
 		 491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  34.99 
 
 		 494 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  34.97 
 
 		 494 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  35.01 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  35.01 
 
 		 493 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2835  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 499 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457826  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  34.95 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  35.81 
 
 		 493 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  35.82 
 
 		 498 aa  286  7e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  34.87 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  34.51 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  34.53 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  35.31 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1203  transcription elongation factor NusA  33.41 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  35.28 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  34.75 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2821  transcription elongation factor NusA  35.89 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  34.5 
 
 		 494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 493 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3240  transcription elongation factor NusA  34.05 
 
 		 499 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.001866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 493 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  34.19 
 
 		 493 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>