More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0521 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  100 
 
 		 537 aa  1078    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  38.98 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  38.88 
 
 		 536 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  37.04 
 
 		 536 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  37.77 
 
 		 544 aa  334  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  37.52 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  37.52 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  40.48 
 
 		 532 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  37.32 
 
 		 545 aa  329  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  37.32 
 
 		 545 aa  329  9e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  37.14 
 
 		 560 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  36.1 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  35.69 
 
 		 534 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  36.18 
 
 		 559 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  36.1 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  37.21 
 
 		 568 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  37.41 
 
 		 545 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  36.02 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  36.02 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  35.97 
 
 		 535 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  35.91 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  34.66 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  43.03 
 
 		 544 aa  319  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  36.1 
 
 		 538 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  35.95 
 
 		 552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  35.56 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  35.03 
 
 		 538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  39.65 
 
 		 539 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  39.43 
 
 		 537 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  36.07 
 
 		 520 aa  311  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  35.08 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 537 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  41.97 
 
 		 548 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  34.42 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 536 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  36.08 
 
 		 537 aa  302  8.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  44.23 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  36.45 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  34.53 
 
 		 506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  41.36 
 
 		 529 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  33.4 
 
 		 497 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  33.2 
 
 		 495 aa  269  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  34.23 
 
 		 498 aa  269  8e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  34.19 
 
 		 492 aa  267  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0989  transcription elongation factor NusA  34.19 
 
 		 499 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0722775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  33.2 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  35.06 
 
 		 493 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  35.06 
 
 		 493 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  32.2 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  33.92 
 
 		 499 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  33.79 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  32.48 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  32.48 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 499 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  32.93 
 
 		 491 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  33.86 
 
 		 494 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1006  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 499 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.614883  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2835  transcription elongation factor NusA  32.67 
 
 		 499 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2828  transcription elongation factor NusA  34.18 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00193559  hitchhiker  0.00416619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  33.47 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  33.94 
 
 		 503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3418  transcription elongation factor NusA  32.6 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  hitchhiker  0.000891299 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1127  transcription elongation factor NusA  32.6 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000246453  unclonable  0.00000000000839394 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3281  transcription elongation factor NusA  32.6 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000185934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  33.94 
 
 		 503 aa  259  7e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3240  transcription elongation factor NusA  32.6 
 
 		 499 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.001866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  33.08 
 
 		 498 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1203  transcription elongation factor NusA  32.08 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  32.54 
 
 		 493 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  32.54 
 
 		 493 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  32.73 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  32.73 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  32.73 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  32.53 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  33.54 
 
 		 493 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  31.43 
 
 		 498 aa  253  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  33.54 
 
 		 493 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2816  transcription elongation factor NusA  34.16 
 
 		 503 aa  253  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  34.25 
 
 		 494 aa  253  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  33.46 
 
 		 503 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  33.93 
 
 		 493 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  33.07 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  32.58 
 
 		 492 aa  249  6e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  30.75 
 
 		 497 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2202  transcription termination factor NusA  31.47 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  32.88 
 
 		 494 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  33.46 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  31.96 
 
 		 506 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  32.95 
 
 		 492 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>