More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3219 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  100 
 
 
503 aa  987    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  50.12 
 
 
381 aa  362  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  49.74 
 
 
384 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  48.63 
 
 
404 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  48.7 
 
 
493 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  45.73 
 
 
401 aa  333  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  49.34 
 
 
381 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  50.14 
 
 
362 aa  329  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  51.21 
 
 
377 aa  329  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  48.5 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  45.5 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  49.59 
 
 
368 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  50.83 
 
 
351 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  49.04 
 
 
368 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  50 
 
 
382 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  49.32 
 
 
368 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  48.91 
 
 
366 aa  323  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  44.7 
 
 
405 aa  322  8e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  49.18 
 
 
383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  49.32 
 
 
359 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  47.96 
 
 
378 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  51.52 
 
 
348 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  50.42 
 
 
333 aa  316  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  48.36 
 
 
382 aa  315  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  49.46 
 
 
329 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  49.18 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  50 
 
 
365 aa  313  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 
346 aa  311  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  45.05 
 
 
413 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  49.86 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  48.31 
 
 
380 aa  310  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  48.9 
 
 
330 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  49.18 
 
 
347 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  47.79 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  49.86 
 
 
365 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  48.78 
 
 
361 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  49.18 
 
 
347 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  48.48 
 
 
344 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  49.03 
 
 
331 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  49.05 
 
 
327 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  47.99 
 
 
337 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  45.92 
 
 
373 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  45.53 
 
 
326 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  47.7 
 
 
381 aa  299  8e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  46.56 
 
 
391 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  46.56 
 
 
391 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  45.65 
 
 
354 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  47.92 
 
 
348 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  47.96 
 
 
364 aa  298  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  47.8 
 
 
337 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  47.79 
 
 
347 aa  297  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  45.21 
 
 
326 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  46.51 
 
 
557 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  46.51 
 
 
557 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  46.51 
 
 
557 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  45.09 
 
 
354 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  43.05 
 
 
433 aa  293  6e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  47.67 
 
 
538 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  44.09 
 
 
491 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  46.54 
 
 
383 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  44.92 
 
 
491 aa  291  2e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 
385 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  44 
 
 
423 aa  291  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  44.96 
 
 
487 aa  290  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  47.89 
 
 
406 aa  289  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  45.75 
 
 
336 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  45.58 
 
 
333 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  37.68 
 
 
449 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  45.97 
 
 
340 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  43.51 
 
 
395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  46.77 
 
 
556 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  47.63 
 
 
355 aa  286  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  44.93 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  45.58 
 
 
559 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  43.8 
 
 
407 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  44.29 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  39.2 
 
 
534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  46.32 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  47.37 
 
 
382 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  57.74 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  43.05 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  44.14 
 
 
442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  44.29 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  43.4 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  43.48 
 
 
365 aa  283  5.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.37 
 
 
572 aa  282  9e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  38.71 
 
 
440 aa  282  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  44.79 
 
 
328 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  45.36 
 
 
353 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  45.36 
 
 
333 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  43.78 
 
 
535 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  43.78 
 
 
535 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>