More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2813 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2813  NusA antitermination factor  100 
 
 		 408 aa  821    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607539  hitchhiker  0.00248823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0957  NusA antitermination factor  42.45 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  44.41 
 
 		 365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  45.99 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  44.51 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  41.81 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  43.62 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  45.15 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  43.19 
 
 		 362 aa  300  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  40.34 
 
 		 506 aa  299  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  44.24 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  38.42 
 
 		 449 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  38.63 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  38.69 
 
 		 536 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  39.36 
 
 		 538 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  39.08 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  44.38 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  39.08 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  42.31 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  42.01 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  42.01 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  42.01 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  42.81 
 
 		 535 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  43.11 
 
 		 538 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  42.18 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  42.51 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  42.51 
 
 		 552 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  39.86 
 
 		 531 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  39.08 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  43.41 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  43.41 
 
 		 545 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  42.26 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  38.98 
 
 		 539 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  42.26 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 		 533 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  37.62 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  39.27 
 
 		 545 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  42.81 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  42.14 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  38.74 
 
 		 540 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  41.59 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  41.59 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.51 
 
 		 537 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  39.01 
 
 		 493 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  39.01 
 
 		 493 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 		 406 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  38.83 
 
 		 536 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  44.07 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  43.83 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  43.83 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  38.83 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.23 
 
 		 536 aa  280  3e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  39.27 
 
 		 493 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  39.27 
 
 		 493 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  40.95 
 
 		 360 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  38.26 
 
 		 541 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  38.26 
 
 		 537 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  38.63 
 
 		 537 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  38.66 
 
 		 538 aa  276  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  38.61 
 
 		 499 aa  276  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  40 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  35.25 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  40.83 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  41.89 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  40.52 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  37.96 
 
 		 493 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  37.96 
 
 		 493 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  37.96 
 
 		 493 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2821  transcription elongation factor NusA  38.48 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  37.96 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  38.04 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  39.06 
 
 		 503 aa  271  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  38.28 
 
 		 506 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  39.06 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  38.52 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  42.15 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  38.94 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  38.44 
 
 		 442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2690  transcription elongation factor NusA  38.22 
 
 		 492 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  37.04 
 
 		 493 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  40.12 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  39.47 
 
 		 444 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  37.43 
 
 		 493 aa  269  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  38.15 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3347  transcription elongation factor NusA  38.68 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  37.14 
 
 		 495 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  37.37 
 
 		 499 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  40.29 
 
 		 493 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  43.47 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3361  transcription elongation factor NusA  37.11 
 
 		 495 aa  266  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0352386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>