171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0321 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 148 aa  291  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  61.76 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  59.56 
 
 		 144 aa  173  9e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  60.29 
 
 		 144 aa  172  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  58.09 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  48.55 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  43.54 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  42.86 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  44.29 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  37.59 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  37.59 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  38.73 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  46.81 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  39.01 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  37.68 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  35.51 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  36.17 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  36.43 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  35.86 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  33.85 
 
 		 147 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  34.62 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  30.91 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  32.31 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  32.85 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  32.14 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  31.75 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  34.81 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  29.79 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  29.08 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  28.37 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  28.37 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  29.71 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  37.14 
 
 		 493 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  34 
 
 		 344 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34 
 
 		 344 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 329 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 404 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  36 
 
 		 354 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  34.91 
 
 		 346 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 442 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  30.19 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  31.18 
 
 		 442 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  36.26 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  30.59 
 
 		 392 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  31.18 
 
 		 442 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 337 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  32.69 
 
 		 473 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  28.85 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  29.47 
 
 		 393 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 344 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  31.63 
 
 		 358 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 366 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 347 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 366 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 333 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  30 
 
 		 362 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  28.85 
 
 		 365 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  32.97 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 344 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 366 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 382 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  27.85 
 
 		 421 aa  45.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  30.93 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 444 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  32.97 
 
 		 498 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 407 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  34.15 
 
 		 344 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  31 
 
 		 337 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 383 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  30.21 
 
 		 324 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  31.03 
 
 		 491 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 327 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  30.17 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  25.96 
 
 		 401 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  31.87 
 
 		 328 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 368 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  29.81 
 
 		 384 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>