More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0383 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  100 
 
 		 498 aa  998    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  34.9 
 
 		 495 aa  316  8e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  43.71 
 
 		 365 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  36.76 
 
 		 482 aa  280  6e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  40.85 
 
 		 383 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  39.03 
 
 		 406 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  42.49 
 
 		 360 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  41.83 
 
 		 382 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  39.06 
 
 		 383 aa  269  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  34.54 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  38.46 
 
 		 383 aa  264  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  38.46 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  40.2 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.1 
 
 		 537 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.1 
 
 		 537 aa  263  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  40.44 
 
 		 385 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  40.38 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  39.37 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  35.48 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  41.4 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  33.89 
 
 		 535 aa  259  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 449 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  41.74 
 
 		 346 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  31.06 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  34 
 
 		 533 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 534 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  41.04 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  33.85 
 
 		 552 aa  257  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  33.77 
 
 		 535 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  34.25 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  33.94 
 
 		 544 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  39.48 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  33.48 
 
 		 541 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  38.89 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  33.11 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  32.88 
 
 		 545 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  33.26 
 
 		 531 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  32.88 
 
 		 545 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  36.8 
 
 		 493 aa  253  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  32.66 
 
 		 536 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.03 
 
 		 536 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  39.19 
 
 		 378 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  39.88 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  31.73 
 
 		 540 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 368 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  36.89 
 
 		 444 aa  250  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 539 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  40.67 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 366 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  32.44 
 
 		 544 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  39.02 
 
 		 401 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  38.48 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  32.12 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  38.48 
 
 		 368 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  31.88 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  32.17 
 
 		 537 aa  247  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  33.03 
 
 		 537 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  38.62 
 
 		 373 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  35.87 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  36.89 
 
 		 442 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  38.04 
 
 		 442 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  37.18 
 
 		 442 aa  246  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  33.86 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  32.21 
 
 		 538 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  32.38 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 544 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  31.76 
 
 		 532 aa  243  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  32.09 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  32.38 
 
 		 536 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  32.84 
 
 		 490 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  34.51 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  31.85 
 
 		 449 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  38.17 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  36.08 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  31.67 
 
 		 501 aa  239  8e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  35.07 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  33.03 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  33.03 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  36.63 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 		 344 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  39.6 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  41.14 
 
 		 366 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>