73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1174 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  63.83 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  51.05 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  42.96 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  42.66 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  42.66 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  43.75 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  44.76 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  37.23 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  41.73 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  38.62 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  37.14 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  35.25 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  40.58 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  40.31 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  36.36 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  37.41 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  34.76 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  35.92 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  42.98 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  37.9 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  34.27 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  29.29 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  32.56 
 
 		 184 aa  85.5  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  39.52 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  37.1 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  34.07 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  30.94 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  32.14 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  38.1 
 
 		 366 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  37.93 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 392 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 441 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 413 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 471 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  35.9 
 
 		 362 aa  46.2  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  36.78 
 
 		 348 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0599  transcription elongation factor NusA  34.52 
 
 		 367 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.329401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 405 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.05 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  28.87 
 
 		 401 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 425 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 468 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  33 
 
 		 503 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  33.71 
 
 		 421 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  32.18 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 425 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  29.35 
 
 		 393 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  29.79 
 
 		 365 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  32.58 
 
 		 374 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 467 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 467 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  35.71 
 
 		 365 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  28.87 
 
 		 405 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 485 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 467 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 337 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 484 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 391 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  29.89 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 329 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  29.89 
 
 		 361 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 358 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>