More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1870 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 425 aa  852    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  83.07 
 
 		 413 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  76.76 
 
 		 426 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  95.21 
 
 		 425 aa  766    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  81.65 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  77.14 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  77.14 
 
 		 412 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  75.84 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  70.2 
 
 		 484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  72.02 
 
 		 497 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  72.28 
 
 		 497 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  71 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  71.95 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  71.69 
 
 		 467 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  71.95 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  72.47 
 
 		 485 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  71.43 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  71.17 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  42.55 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  40.5 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  40.95 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  42.4 
 
 		 365 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  41.76 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  42.86 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  41.42 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  41.18 
 
 		 475 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  39.47 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  39.47 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  42.62 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 368 aa  256  7e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  40.7 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  39.2 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  39.89 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  41.76 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  38.5 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  41.5 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  40.55 
 
 		 381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  41.51 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  38.44 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  41.99 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  37.97 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  41.01 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  44.29 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  40.05 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.31 
 
 		 442 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  40.59 
 
 		 383 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  41.07 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  40.32 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  40.32 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  39.84 
 
 		 344 aa  242  9e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  40.32 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  38.61 
 
 		 369 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  38.61 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  39.57 
 
 		 378 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  39.29 
 
 		 344 aa  239  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  39.02 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  40.86 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  40.16 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  37.27 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  40.55 
 
 		 541 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  39.78 
 
 		 392 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  37.84 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  37.71 
 
 		 536 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  37.14 
 
 		 538 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  37.53 
 
 		 443 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  39.28 
 
 		 491 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  40.27 
 
 		 537 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 		 423 aa  232  9e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  39.55 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.44 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 537 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  38.96 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  39.84 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  35.53 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  38.6 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  39.45 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  37.14 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  39.56 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  40.97 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 		 538 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  44.83 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  44.83 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  44.83 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  40.55 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  42.38 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  38.73 
 
 		 545 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  38.73 
 
 		 545 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  37.6 
 
 		 532 aa  225  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>