More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0597 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  92 
 
 
425 aa  787    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  100 
 
 
425 aa  859    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  78.24 
 
 
426 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  83.33 
 
 
413 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  77.5 
 
 
405 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  76.36 
 
 
441 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  76 
 
 
412 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  76 
 
 
412 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  71.69 
 
 
484 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  66.99 
 
 
497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  66.99 
 
 
497 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  70.91 
 
 
471 aa  559  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  70.91 
 
 
485 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  70.39 
 
 
467 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  70.91 
 
 
481 aa  555  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  70.13 
 
 
467 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  67.81 
 
 
468 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  67.57 
 
 
467 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  42.39 
 
 
383 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 
382 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  40.82 
 
 
346 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  42.42 
 
 
365 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  42.98 
 
 
362 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  40.58 
 
 
406 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  41.1 
 
 
373 aa  255  9e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  42.58 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  42.58 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  39.9 
 
 
377 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  42.3 
 
 
366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  42.62 
 
 
442 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  39.4 
 
 
404 aa  252  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  42.58 
 
 
368 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  38.92 
 
 
380 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  39.84 
 
 
475 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  41.5 
 
 
444 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  40.16 
 
 
493 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  40.27 
 
 
384 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  40.05 
 
 
385 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  38.87 
 
 
449 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  40 
 
 
381 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  41.99 
 
 
442 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 
407 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  41.34 
 
 
391 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  41.34 
 
 
391 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  43.44 
 
 
372 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  40.91 
 
 
381 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  40.44 
 
 
369 aa  246  6e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  41.08 
 
 
382 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  40.81 
 
 
385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  40.37 
 
 
383 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.03 
 
 
442 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  40.6 
 
 
344 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  40.11 
 
 
383 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  42.6 
 
 
393 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  40.11 
 
 
382 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  40.83 
 
 
359 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  38.86 
 
 
378 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  39.56 
 
 
344 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  38.54 
 
 
491 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  38.42 
 
 
536 aa  235  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  40.44 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  40.64 
 
 
401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  39.24 
 
 
532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  37.8 
 
 
429 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  40.87 
 
 
537 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  40 
 
 
392 aa  233  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  36.61 
 
 
433 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  40.6 
 
 
537 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  39.55 
 
 
491 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  40.16 
 
 
539 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  38.96 
 
 
538 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  36.39 
 
 
538 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  38.15 
 
 
423 aa  231  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  40.86 
 
 
365 aa  231  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.44 
 
 
360 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  39.51 
 
 
536 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 
540 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  39.83 
 
 
487 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 
538 aa  229  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  39.51 
 
 
544 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  37 
 
 
443 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  39.23 
 
 
366 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  39.23 
 
 
366 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  38.96 
 
 
545 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  39.67 
 
 
344 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  47.39 
 
 
506 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  38.96 
 
 
545 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  37.29 
 
 
357 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  36.49 
 
 
440 aa  227  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.34 
 
 
536 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  38.69 
 
 
560 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  40 
 
 
347 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  45.04 
 
 
557 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>