More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2022 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 441 aa  874    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  73.57 
 
 		 497 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  73.81 
 
 		 484 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  73.57 
 
 		 497 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  77.08 
 
 		 413 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  74.45 
 
 		 471 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  73.81 
 
 		 485 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  74.45 
 
 		 481 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  76.36 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  73.33 
 
 		 426 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  75.84 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  71.01 
 
 		 468 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  70.76 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  71.01 
 
 		 467 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  70.27 
 
 		 467 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  74.15 
 
 		 405 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  72.92 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  72.92 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  44.88 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  43.8 
 
 		 383 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 		 346 aa  272  9e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  43.53 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  43.89 
 
 		 362 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  43.43 
 
 		 380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 366 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  42.97 
 
 		 373 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  43.02 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  41.62 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  41.55 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  41.69 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  40.27 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  42.39 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  44.04 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  42.66 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  44.08 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  44.32 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  41.69 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  41.69 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  38.55 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  40.68 
 
 		 369 aa  249  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  40.33 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  42.03 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  43.92 
 
 		 372 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  40.65 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  45.08 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  41.57 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  37.87 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  38.08 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  41.73 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  41.73 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  38.5 
 
 		 475 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  39.94 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  40.65 
 
 		 385 aa  236  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  39.84 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  39.84 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  38.4 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  37.79 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  40.92 
 
 		 401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  39.57 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  39.57 
 
 		 382 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  40.44 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  40.59 
 
 		 545 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  40.77 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  40.59 
 
 		 545 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  40.06 
 
 		 537 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  37.16 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  41 
 
 		 536 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  40.59 
 
 		 560 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  39.78 
 
 		 540 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  39.55 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  39.89 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  39.25 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  48.91 
 
 		 347 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  49.82 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  40 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  48.34 
 
 		 557 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  48.34 
 
 		 557 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  48.34 
 
 		 557 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  37.7 
 
 		 344 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  39.78 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  47.72 
 
 		 506 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  45.72 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  39.5 
 
 		 539 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  43.17 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  40.32 
 
 		 536 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  40.17 
 
 		 487 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  38.16 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  40.32 
 
 		 545 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  40.89 
 
 		 538 aa  226  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  39.34 
 
 		 572 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>