More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1410 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  100 
 
 		 381 aa  768    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  50.12 
 
 		 503 aa  362  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  50.72 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  47.08 
 
 		 384 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  46.3 
 
 		 493 aa  322  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  47.52 
 
 		 404 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  49.28 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  49.57 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  52.04 
 
 		 351 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  48.99 
 
 		 383 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  53.12 
 
 		 348 aa  315  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  46.56 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  50.58 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  47.58 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  45.79 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  47.66 
 
 		 487 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  47.08 
 
 		 491 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  46.49 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  49.37 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  46.46 
 
 		 373 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  47.37 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  49.22 
 
 		 333 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  48.16 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  48.75 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  47.95 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  49.85 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  44.93 
 
 		 368 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  50.3 
 
 		 348 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  50.31 
 
 		 353 aa  295  7e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  49.54 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  48.6 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  44.93 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  47.93 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  47.93 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  47.93 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  45.22 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  47.71 
 
 		 337 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  44.93 
 
 		 368 aa  292  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  46.21 
 
 		 401 aa  292  7e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  47.43 
 
 		 346 aa  292  8e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  47.67 
 
 		 372 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  49.21 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  48.37 
 
 		 337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  46.38 
 
 		 444 aa  288  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  50.64 
 
 		 326 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  48.76 
 
 		 330 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  49.22 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  44.83 
 
 		 380 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  49.07 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  49.13 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  49.38 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  49.23 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  45.93 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  45.93 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  42.02 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  42.02 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  45.5 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  54.37 
 
 		 406 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  49.68 
 
 		 381 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  48.17 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  46.69 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  45.53 
 
 		 442 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  46.34 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  44.94 
 
 		 328 aa  276  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  44.12 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  48.72 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  54.88 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  43.75 
 
 		 365 aa  272  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  44.02 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  44.02 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  42.82 
 
 		 405 aa  272  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  42.49 
 
 		 516 aa  272  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  43.82 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  44.19 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  44.47 
 
 		 413 aa  268  8e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 		 506 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  55.28 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  55.28 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.28 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  47.08 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  42.77 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  45.09 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  47.08 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  54.66 
 
 		 556 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  43.06 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  42.52 
 
 		 572 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  47.06 
 
 		 557 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  43.71 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  40.61 
 
 		 423 aa  260  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>