106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1778 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  62.41 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  58.45 
 
 		 147 aa  172  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  56.85 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  58.99 
 
 		 151 aa  167  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  47.97 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  43.08 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  44.44 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  44.44 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  42.4 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  48 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  43.31 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  41.04 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  35.88 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  36.64 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  36.64 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  37.9 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  34.62 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  35.56 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  34.62 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  34.92 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  36.21 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  35.2 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.28 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  41.75 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  44.32 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  29.63 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  37.93 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  28.3 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  37.93 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  39.08 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  39.77 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  32.26 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 322 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  37.35 
 
 		 341 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  39.76 
 
 		 493 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  34.44 
 
 		 441 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  27.62 
 
 		 392 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  32.22 
 
 		 411 aa  47.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  29.49 
 
 		 523 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  30.86 
 
 		 418 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 492 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  27.08 
 
 		 502 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  27.72 
 
 		 393 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  28.21 
 
 		 538 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  28.21 
 
 		 532 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  27.78 
 
 		 548 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  37.5 
 
 		 357 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 428 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  28.4 
 
 		 491 aa  43.9  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 495 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  34.52 
 
 		 401 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2202  transcription termination factor NusA  28.21 
 
 		 497 aa  43.5  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0468  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 517 aa  43.9  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 429 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 501 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  27.62 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0562  transcription elongation factor NusA  32.05 
 
 		 517 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.535647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 497 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  32.14 
 
 		 524 aa  42.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  31.87 
 
 		 443 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  27.27 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 365 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0807  transcription elongation factor NusA  27.27 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  28.85 
 
 		 534 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  29.49 
 
 		 493 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  26.92 
 
 		 499 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  28.21 
 
 		 506 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  28.21 
 
 		 531 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  27.96 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  30.86 
 
 		 413 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  28.21 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 492 aa  40.8  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  28.21 
 
 		 536 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 499 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  30.49 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  30.88 
 
 		 520 aa  40.8  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 537 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  28.21 
 
 		 493 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 499 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2828  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 499 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00193559  hitchhiker  0.00416619 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 537 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 492 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  30.38 
 
 		 405 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 503 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  26.92 
 
 		 535 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0140  transcription elongation factor NusA  29.63 
 
 		 411 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl292  transcription elongation factor NusA  32.43 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.113528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  28.75 
 
 		 538 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  34.18 
 
 		 441 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  28.75 
 
 		 536 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  30.38 
 
 		 494 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  32.1 
 
 		 417 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  30.12 
 
 		 433 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  25.56 
 
 		 537 aa  40  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  28.75 
 
 		 537 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  27.47 
 
 		 498 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2813  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 408 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607539  hitchhiker  0.00248823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  28.21 
 
 		 494 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>