86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0786 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  59.2 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  59.2 
 
 		 173 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  56.82 
 
 		 173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  60.37 
 
 		 173 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  41.73 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  40.83 
 
 		 143 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  35.46 
 
 		 143 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  34.11 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  31.71 
 
 		 154 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  33.33 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  33.33 
 
 		 149 aa  87.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  34.29 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  32.56 
 
 		 141 aa  85.5  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  36.09 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  30.34 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  31.97 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  44.32 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  34.81 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  33.04 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  30.6 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  27.69 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  32.2 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  33.33 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  39.44 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  31.11 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  32.09 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  31.34 
 
 		 144 aa  62  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  30.6 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  29.57 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0883  PhoH family protein  30.39 
 
 		 370 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0784  PhoH family protein  30.63 
 
 		 371 aa  48.9  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0304988  normal  0.163823 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  37.5 
 
 		 407 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  36.25 
 
 		 391 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  36.25 
 
 		 391 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1769  PhoH family protein  30.39 
 
 		 371 aa  47.8  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  32.97 
 
 		 401 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  32.05 
 
 		 358 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  32.05 
 
 		 362 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  23.36 
 
 		 385 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  37.97 
 
 		 493 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  35.96 
 
 		 347 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 383 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  30.65 
 
 		 337 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 382 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  36.25 
 
 		 373 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 348 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  29.25 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  32.69 
 
 		 392 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  26.44 
 
 		 520 aa  43.5  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  30.61 
 
 		 393 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 382 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  46 
 
 		 329 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  31.18 
 
 		 449 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  27.86 
 
 		 482 aa  43.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 383 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2115  PhoH family protein  27.03 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2559  transcription termination factor NusA  33.75 
 
 		 442 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 395 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  32.41 
 
 		 537 aa  42.4  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 383 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  42 
 
 		 351 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  29.03 
 
 		 360 aa  42.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 449 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  24.79 
 
 		 537 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  36.73 
 
 		 402 aa  41.6  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  44 
 
 		 333 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  42 
 
 		 333 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  37.21 
 
 		 357 aa  41.2  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  44 
 
 		 340 aa  41.2  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 468 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  27.16 
 
 		 442 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  44 
 
 		 353 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  28.75 
 
 		 442 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  30.86 
 
 		 556 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  42 
 
 		 339 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0596  PhoH family protein  28.57 
 
 		 379 aa  40.8  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  28.75 
 
 		 442 aa  40.8  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>