77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2154 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 166 aa  325  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  65.45 
 
 		 146 aa  207  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  48.81 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  46.39 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  45.18 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  38.96 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  35.37 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  34.94 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  33.94 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  33.94 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  34.76 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  35.37 
 
 		 148 aa  91.7  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  34.15 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  30.91 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  32.93 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  32.73 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  31.52 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  29.22 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  30.3 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  30.3 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  30.49 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  30.38 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  30.49 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  28.3 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  27.95 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  29.52 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  28.57 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  26.28 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  27.78 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  25.75 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  24.55 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  24.55 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  23.95 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 405 aa  48.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  24.07 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  32.29 
 
 		 401 aa  45.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  34.41 
 
 		 362 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  28.12 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  31.94 
 
 		 441 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  31.43 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  32.61 
 
 		 493 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  38.33 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  34.62 
 
 		 362 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  34.09 
 
 		 337 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.55 
 
 		 373 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  32.84 
 
 		 475 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 333 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  31.87 
 
 		 392 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 368 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  30.65 
 
 		 344 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  30.95 
 
 		 337 aa  41.2  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 353 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 329 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  27.17 
 
 		 380 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 412 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 412 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 333 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  30.68 
 
 		 333 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  31.87 
 
 		 365 aa  40.8  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  35 
 
 		 442 aa  40.8  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  31.88 
 
 		 405 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>