More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  100 
 
 		 365 aa  727    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  74.93 
 
 		 344 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  69.4 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  72.5 
 
 		 364 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  68.68 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  65.99 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  65.42 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  64.77 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  63.94 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  62.64 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  63.98 
 
 		 324 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  62.93 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  63.4 
 
 		 333 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  63.56 
 
 		 331 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  62.97 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  62.09 
 
 		 357 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  61.48 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  63.25 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  61.67 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  59.44 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  60 
 
 		 347 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  59.55 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  59.55 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  58.56 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  59.55 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  59.71 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  57.03 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  57.07 
 
 		 337 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  58.29 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  55.86 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  56.21 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  58.22 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  57.67 
 
 		 348 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  55.34 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  59.27 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  55.04 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  53.89 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  47.31 
 
 		 384 aa  332  6e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  49.3 
 
 		 373 aa  322  9.000000000000001e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  50.29 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  45.66 
 
 		 493 aa  316  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  43.16 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  49.71 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  50 
 
 		 503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  43.7 
 
 		 404 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  47.51 
 
 		 383 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  48.41 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  45.01 
 
 		 382 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  47.13 
 
 		 377 aa  309  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  48.97 
 
 		 382 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  45.51 
 
 		 346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  45.1 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  44.82 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  43.39 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  45.07 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  44.48 
 
 		 378 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  46.92 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  45.38 
 
 		 442 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  44.93 
 
 		 442 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  42.09 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  41.81 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  43.8 
 
 		 442 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  43.77 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  44.61 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  43.6 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 491 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  42.82 
 
 		 444 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  45.48 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  42.32 
 
 		 487 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  43.55 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 491 aa  262  8e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  43.4 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  43.7 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  39.77 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  42.58 
 
 		 538 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  42.82 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  41.44 
 
 		 537 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  40 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  40.87 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  41.53 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  40.87 
 
 		 535 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 449 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 		 552 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  44.06 
 
 		 406 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 535 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  41.27 
 
 		 536 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 537 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 537 aa  252  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  42.01 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>