More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1180 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  100 
 
 		 361 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  88.22 
 
 		 365 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  71.22 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  71.04 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  63.64 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  68.21 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  66.25 
 
 		 324 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  68.12 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  66.77 
 
 		 337 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  65.84 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  66.36 
 
 		 331 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  61.47 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  63.9 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  60.98 
 
 		 347 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  64.05 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  62.29 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  60.47 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  60.47 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  60.47 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  58.2 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  60.98 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  61.54 
 
 		 346 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  61.7 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  59.44 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  61.28 
 
 		 333 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  60.37 
 
 		 333 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  60.36 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  62.16 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  61.77 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  59.94 
 
 		 326 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  58.59 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  59.32 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  62.17 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  58.2 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  58.07 
 
 		 328 aa  356  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  48.31 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  48.25 
 
 		 404 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  49.41 
 
 		 381 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  47.8 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  49.56 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  49.44 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  49.56 
 
 		 382 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  48.99 
 
 		 365 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  50.72 
 
 		 359 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  49.57 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  46.11 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  47.35 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  50 
 
 		 382 aa  318  7e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  48.99 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  47.97 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  45.77 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  48.8 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  49.17 
 
 		 503 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  45.48 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  45.19 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  44.7 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  49.24 
 
 		 355 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  48.59 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  51.26 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 391 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 391 aa  289  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  44.61 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  43.55 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  43.55 
 
 		 366 aa  285  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  59.49 
 
 		 524 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  43.38 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  43.15 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  44.38 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  41.78 
 
 		 491 aa  273  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  44.09 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  42.9 
 
 		 487 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  42.69 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  45.16 
 
 		 406 aa  265  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  42.18 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  41.5 
 
 		 442 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  42.98 
 
 		 552 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.15 
 
 		 537 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  41.54 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.15 
 
 		 537 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  41.54 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  41.71 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  41.69 
 
 		 444 aa  262  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  42.82 
 
 		 538 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  42.69 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  42.69 
 
 		 535 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  43.27 
 
 		 534 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  40.23 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  41.49 
 
 		 475 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  39.12 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  44.15 
 
 		 535 aa  259  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  42.27 
 
 		 572 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  44.84 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>