More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1325 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  96.54 
 
 		 347 aa  670    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 347 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  74.46 
 
 		 347 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  70.92 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  71.04 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  69.67 
 
 		 333 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  68.86 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  68.66 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  69.54 
 
 		 348 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  68.63 
 
 		 327 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  66.47 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  67.43 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  69.88 
 
 		 365 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  70 
 
 		 351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  68.92 
 
 		 324 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  67.91 
 
 		 331 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  63.56 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  63.64 
 
 		 333 aa  433  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  65.45 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  65.45 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  65.45 
 
 		 347 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  63.94 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  65.63 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  63.77 
 
 		 337 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  65.03 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  62.39 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  61.18 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  59.94 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  58.56 
 
 		 365 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  60.49 
 
 		 357 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  61.89 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  60.96 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  60.87 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  60.31 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  58.36 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  48.34 
 
 		 384 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  48.99 
 
 		 404 aa  328  6e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  49.57 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  47.25 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  47.44 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  50 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  48.71 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  48.73 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  48.14 
 
 		 381 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  48.56 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  49.44 
 
 		 359 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  51.96 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  50.29 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  51.25 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  47.56 
 
 		 373 aa  307  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  49.18 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  50.9 
 
 		 360 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  47.35 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  46.73 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  63.98 
 
 		 524 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  46.76 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  47.06 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  45.4 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  45.4 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  46.47 
 
 		 366 aa  298  9e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  44.83 
 
 		 407 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  44.64 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  44.15 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  45.89 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  46.18 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  46.04 
 
 		 491 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  49.22 
 
 		 381 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  44.9 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  47.93 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  45.16 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  45.16 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  42.69 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  42.61 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.82 
 
 		 442 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  42.44 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  45.29 
 
 		 506 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  44.25 
 
 		 538 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 533 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  44.54 
 
 		 535 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  44.94 
 
 		 516 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  45.88 
 
 		 536 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.9 
 
 		 572 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  43.07 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  43.94 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  46.08 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  45.82 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  45 
 
 		 544 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.84 
 
 		 536 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  45.13 
 
 		 545 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  42.27 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  44.84 
 
 		 545 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  44.84 
 
 		 545 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>