More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06990 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06990  transcription termination factor NusA  100 
 
 
328 aa  659    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.045729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  73.99 
 
 
326 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  74.92 
 
 
326 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  66.97 
 
 
339 aa  438  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  62.93 
 
 
365 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  66.46 
 
 
327 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  65.15 
 
 
344 aa  424  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  64.83 
 
 
333 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  64.89 
 
 
329 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  66.98 
 
 
346 aa  421  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  63.58 
 
 
337 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  64.58 
 
 
354 aa  413  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  64.88 
 
 
364 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  61.76 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  63.14 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  62.08 
 
 
348 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  62.62 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  60.56 
 
 
348 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  59.94 
 
 
337 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  62.11 
 
 
347 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  61.66 
 
 
328 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  60.87 
 
 
347 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  59.57 
 
 
357 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  61.18 
 
 
347 aa  385  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  57.98 
 
 
340 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  57.67 
 
 
336 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  57.06 
 
 
333 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  58.28 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  60.74 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  57.98 
 
 
353 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  58.28 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  58.28 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  58.07 
 
 
333 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  58.07 
 
 
365 aa  359  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  58.07 
 
 
361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  52.29 
 
 
355 aa  321  9.000000000000001e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  51.06 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  46.63 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  46.2 
 
 
346 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  46.71 
 
 
404 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  47.9 
 
 
381 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  48.08 
 
 
377 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  46.41 
 
 
359 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  44.79 
 
 
503 aa  281  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  45.21 
 
 
493 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  46.11 
 
 
365 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  45.43 
 
 
373 aa  279  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  46.99 
 
 
382 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  43.56 
 
 
380 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  45.21 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  48.72 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  44.01 
 
 
382 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  43.71 
 
 
378 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  45.19 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  42.81 
 
 
383 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  43.88 
 
 
491 aa  264  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  42.81 
 
 
368 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  42.26 
 
 
354 aa  262  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  43.58 
 
 
491 aa  261  8e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  43.71 
 
 
407 aa  261  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  44.91 
 
 
391 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  44.91 
 
 
391 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
368 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  43.28 
 
 
487 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 
366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  42.51 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  42.56 
 
 
442 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 
366 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  42.56 
 
 
442 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  42.6 
 
 
366 aa  258  9e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  41.62 
 
 
344 aa  255  8e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  44.48 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  42.31 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.48 
 
 
442 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  41.32 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  40.96 
 
 
360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3967  NusA domain protein  55.02 
 
 
524 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882559  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  41.02 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  39.7 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  42.56 
 
 
369 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  49.61 
 
 
538 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  41 
 
 
344 aa  235  6e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2813  NusA antitermination factor  38.92 
 
 
408 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607539  hitchhiker  0.00248823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  42.77 
 
 
401 aa  229  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  49.79 
 
 
406 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  40.75 
 
 
405 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  40.17 
 
 
392 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  46.69 
 
 
506 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  51.26 
 
 
556 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  39.36 
 
 
393 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  37.07 
 
 
391 aa  223  4e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  50 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  50 
 
 
557 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>