More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09350 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  100 
 
 		 401 aa  817    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  80 
 
 		 402 aa  650    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  81.84 
 
 		 405 aa  654    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  66.83 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  45.27 
 
 		 503 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  49.45 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  48.49 
 
 		 362 aa  308  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  45.96 
 
 		 381 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  47.3 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  47.24 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  47.25 
 
 		 382 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  45.73 
 
 		 365 aa  290  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  44.78 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  46.7 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  46.34 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  45.36 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  43.88 
 
 		 493 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  45.41 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  45.03 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  47.94 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  47.81 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  41.43 
 
 		 378 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  47.79 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  44.44 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  45.58 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  42.86 
 
 		 346 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  46.13 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  47.8 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  46.9 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  43.75 
 
 		 442 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  43.73 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  43.29 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  44.57 
 
 		 354 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  43.13 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  44.39 
 
 		 407 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  45.53 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  46.72 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  43.29 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  41.56 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  41.6 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  42.35 
 
 		 442 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  43.33 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  45.82 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  45.4 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  39.53 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  39.53 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  41.99 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  43.95 
 
 		 331 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  45.61 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  39.94 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  43.54 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  43.54 
 
 		 535 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  43.54 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  42.7 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  43.49 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  43.49 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  46.31 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  43.87 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  41.46 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  39.67 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  42.06 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  41.99 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  42.22 
 
 		 538 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  43.92 
 
 		 544 aa  253  6e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 535 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  42.7 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  42.7 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  43.01 
 
 		 559 aa  252  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.3 
 
 		 537 aa  252  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  42.54 
 
 		 536 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  43.17 
 
 		 347 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  43.25 
 
 		 365 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  39.67 
 
 		 487 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  45.4 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  42.02 
 
 		 545 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  43.45 
 
 		 538 aa  250  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  42.02 
 
 		 545 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  41.69 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  43.66 
 
 		 523 aa  250  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  43.99 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  42.02 
 
 		 560 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  41.41 
 
 		 572 aa  248  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  44.44 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  42.9 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  43.45 
 
 		 535 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  43.45 
 
 		 535 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  41.92 
 
 		 544 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>