More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0831 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  100 
 
 		 413 aa  833    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  66.58 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  66.83 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  64.76 
 
 		 405 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  44.82 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  45.63 
 
 		 362 aa  270  5e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  43.72 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  43.56 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  47.69 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  45.24 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  46.05 
 
 		 384 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  44.57 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  42.28 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  44.2 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  44.41 
 
 		 382 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.01 
 
 		 373 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  42.78 
 
 		 368 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  43.05 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  41.89 
 
 		 366 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  40.21 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  45.69 
 
 		 327 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  42.49 
 
 		 365 aa  245  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  43.13 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  41.48 
 
 		 346 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  43.6 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  41.26 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  46.18 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  45.03 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  46.11 
 
 		 346 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  40.17 
 
 		 534 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  39.22 
 
 		 433 aa  235  9e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  43.5 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  45.53 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  41.83 
 
 		 406 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  39.07 
 
 		 491 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  39.39 
 
 		 491 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  45.48 
 
 		 329 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  42.61 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  39.62 
 
 		 487 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  40.06 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  40.88 
 
 		 544 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  40.72 
 
 		 538 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  37.86 
 
 		 366 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  41.01 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  40.41 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  39.67 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  40.41 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  40.11 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  37.6 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  39.95 
 
 		 442 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  42.23 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  40.11 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  39.66 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  40.74 
 
 		 523 aa  225  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  41.48 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  43.18 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  42.52 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  40.4 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  40.4 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  39.12 
 
 		 537 aa  224  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  38.32 
 
 		 559 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  41.11 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  42.29 
 
 		 336 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  38.4 
 
 		 537 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  38.4 
 
 		 537 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  37.57 
 
 		 534 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  42.9 
 
 		 347 aa  223  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  38.4 
 
 		 535 aa  222  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  38.84 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  39.02 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  42.65 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  41.16 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  41.76 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  42.09 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  44.35 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  46.24 
 
 		 590 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  42.15 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  43.44 
 
 		 337 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  41.64 
 
 		 423 aa  219  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  42.19 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  40.17 
 
 		 506 aa  219  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  41.53 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  38.29 
 
 		 533 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  41.71 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  38.02 
 
 		 538 aa  219  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1508  transcription termination factor NusA  42.49 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.736288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  38.29 
 
 		 535 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>