More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0373 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  61.49 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  61.49 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  57.05 
 
 		 154 aa  192  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  64.19 
 
 		 148 aa  189  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  49.64 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  45.07 
 
 		 143 aa  136  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  40.67 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  39.31 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  39.31 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  36.62 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  40.28 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  39.72 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  39.58 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  38.36 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  37.5 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  43.57 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  35.33 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  41.04 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  36.11 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  44.09 
 
 		 151 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  36.77 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  37.34 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  36.08 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  36.08 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  43.28 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  36.05 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  36.62 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  32.39 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  33.1 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  32.39 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.34 
 
 		 471 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  31.39 
 
 		 497 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  34 
 
 		 441 aa  60.8  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  31.39 
 
 		 497 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  31.06 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  39.81 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  32.43 
 
 		 392 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 412 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 412 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  30.09 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  28.89 
 
 		 405 aa  57.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  28.47 
 
 		 467 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  34.74 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  31.09 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  32.46 
 
 		 531 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  34.58 
 
 		 534 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  32.99 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  31.48 
 
 		 426 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  30.66 
 
 		 552 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 537 aa  55.1  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  28.93 
 
 		 468 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  32.71 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 475 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  28.32 
 
 		 467 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 366 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 537 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 481 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  34.04 
 
 		 344 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 548 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  31 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 366 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 368 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 535 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  30.51 
 
 		 536 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  30.97 
 
 		 538 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  34 
 
 		 442 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 485 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  34 
 
 		 442 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  34.74 
 
 		 373 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  30.97 
 
 		 536 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  33 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 366 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  29.92 
 
 		 572 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  30.83 
 
 		 532 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  34 
 
 		 354 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  31.58 
 
 		 402 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  26.36 
 
 		 495 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  36 
 
 		 444 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  33.05 
 
 		 493 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  30.97 
 
 		 537 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 383 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>