203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1200 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  71.13 
 
 		 143 aa  197  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  47.18 
 
 		 143 aa  153  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  51.75 
 
 		 144 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  51.05 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  50.35 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  49.65 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  42.96 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  48.55 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  41.67 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  41.67 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  42.96 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  41.26 
 
 		 154 aa  120  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  38.57 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  41.43 
 
 		 148 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  42.65 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  43.08 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.62 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  40.15 
 
 		 142 aa  103  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  34.88 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  32.85 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  34.31 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.14 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  34.88 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 173 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  37.86 
 
 		 173 aa  92  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  35.46 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  33.81 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  36.43 
 
 		 173 aa  90.5  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  31.39 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  29.22 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 351 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0033  transcription elongation factor NusA  30.11 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122242  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  34.78 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  36.96 
 
 		 339 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  29.03 
 
 		 482 aa  51.2  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 344 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  34.78 
 
 		 329 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 324 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1214  NusA antitermination factor  27.96 
 
 		 414 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.75759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  32.53 
 
 		 463 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  35.87 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  27.71 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  35.87 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  30.11 
 
 		 344 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  31.18 
 
 		 498 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  26.88 
 
 		 418 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  27.08 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 362 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 497 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 471 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 337 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  27.37 
 
 		 467 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 497 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  28.87 
 
 		 344 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0138  transcription elongation factor NusA  27.96 
 
 		 411 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  27.84 
 
 		 344 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  35.87 
 
 		 348 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  28.71 
 
 		 413 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  29.49 
 
 		 358 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  31.18 
 
 		 366 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 346 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  28.72 
 
 		 402 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 485 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  26.32 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  27.21 
 
 		 534 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  31.18 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 493 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  29.35 
 
 		 331 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  32.61 
 
 		 357 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1629  transcription elongation factor NusA  26.21 
 
 		 417 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  28.83 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  30.3 
 
 		 441 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  27.37 
 
 		 467 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 484 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  30.21 
 
 		 413 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  31.33 
 
 		 392 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  28.42 
 
 		 481 aa  44.7  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 502 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  30.14 
 
 		 361 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  26.32 
 
 		 467 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0508  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 366 aa  44.7  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.904509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  33.67 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  27.96 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 524 aa  43.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3602  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.761318  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3476  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 500 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4490  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 503 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  29.59 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3644  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 500 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>