More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0772 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  100 
 
 		 362 aa  716    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  52.91 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  36.99 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  37.57 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.82 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  37.46 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  35.86 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  36.31 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  36.31 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  34.29 
 
 		 382 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  37.85 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  34.29 
 
 		 383 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  35.45 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  36.39 
 
 		 442 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  36.21 
 
 		 442 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  35.04 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  37.01 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  35.5 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  36.23 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  36.23 
 
 		 382 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  38.66 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  36.81 
 
 		 383 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  35.92 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  35.78 
 
 		 493 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  36.47 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  36.76 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  34.02 
 
 		 366 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  33.43 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  36.89 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  33.52 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  36.16 
 
 		 492 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  212  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  34.57 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  36.03 
 
 		 491 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  31.12 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  36.18 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  31.7 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  31.7 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.07 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 366 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0876  transcription elongation factor NusA  35.53 
 
 		 491 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0313079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  35 
 
 		 490 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  35.04 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  35.65 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  36.23 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  31.86 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  34.39 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  34.2 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.04 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  33.62 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  33.06 
 
 		 531 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  35.24 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  34.82 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  33.63 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  32.86 
 
 		 491 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  33.04 
 
 		 495 aa  195  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  32.74 
 
 		 440 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  33.13 
 
 		 488 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  32.55 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  32.49 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  34.97 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  34.97 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  36.34 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  33.43 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  33.62 
 
 		 538 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  31.92 
 
 		 492 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2029  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  34.42 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  30.06 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  34.1 
 
 		 534 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  32.17 
 
 		 540 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  34.01 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  33.63 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  32.18 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 491 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 556 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 491 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  32.24 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>