142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1385 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  62.24 
 
 		 147 aa  189  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  57.75 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  58.87 
 
 		 147 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  58.99 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  42.86 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  42.86 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  46.4 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  41.04 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  51.61 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  39.06 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  38.46 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  44.09 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  36.57 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  32.67 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  37.59 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  36.36 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  39.52 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  35.07 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  36.15 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  34.56 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  39.85 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  32.85 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  43.88 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.56 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  35.04 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  38.14 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  35.9 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 173 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  35.9 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  33.04 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  30.49 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.05 
 
 		 341 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  28.23 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 506 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 572 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 347 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  35.63 
 
 		 340 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  31.71 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 444 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 407 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 495 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  27.91 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  30.38 
 
 		 537 aa  44.3  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  38.16 
 
 		 362 aa  43.9  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  31.82 
 
 		 365 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  37.5 
 
 		 328 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  28.18 
 
 		 493 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  34.48 
 
 		 373 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  31.4 
 
 		 538 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  35.96 
 
 		 353 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  29.49 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  29.49 
 
 		 391 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  30.23 
 
 		 556 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  35.53 
 
 		 371 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  31.65 
 
 		 557 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03036  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0536  NusA antitermination factor  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 496 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02987  hypothetical protein  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  26.74 
 
 		 538 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  28.74 
 
 		 401 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4490  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  30.38 
 
 		 487 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3361  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0352386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3653  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3347  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 496 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0529  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3465  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246943  normal  0.841765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  33.71 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3602  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 495 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.761318  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3545  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3582  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3477  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3476  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3644  transcription elongation factor NusA  31.76 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  33.33 
 
 		 357 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  27.91 
 
 		 535 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  30.23 
 
 		 497 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  29.49 
 
 		 378 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  31.82 
 
 		 473 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  26.74 
 
 		 559 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  27.91 
 
 		 533 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3606  transcription elongation factor NusA  30.59 
 
 		 495 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0209266  normal  0.0368341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  27.91 
 
 		 545 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  27.91 
 
 		 545 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 493 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2202  transcription termination factor NusA  30.23 
 
 		 497 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  27.59 
 
 		 362 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  27.91 
 
 		 534 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  30.49 
 
 		 442 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>