128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0355 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  65.45 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  55.17 
 
 		 141 aa  155  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  55.17 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  50.68 
 
 		 142 aa  134  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  39.55 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  39.46 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  39.31 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  36.99 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  36.99 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  38.78 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  37.41 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  35.86 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  35.86 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  35.17 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  31.39 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  34.72 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  35.17 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  34.27 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  34.56 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  33.1 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  31.97 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  34.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  29.63 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  29.55 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  29.93 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  28.37 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  30.28 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  29.25 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  29.25 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  27.89 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  23.61 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  40.45 
 
 		 405 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  41.98 
 
 		 344 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  41.98 
 
 		 329 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  40 
 
 		 347 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  37.96 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  38.67 
 
 		 362 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  38.37 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 337 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  35.11 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  38.82 
 
 		 333 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  33.7 
 
 		 355 aa  48.5  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  41.98 
 
 		 365 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  33.77 
 
 		 441 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 353 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  41.18 
 
 		 348 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  36.59 
 
 		 368 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  37.65 
 
 		 340 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  32.61 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  38.27 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 331 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  39.02 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  34.15 
 
 		 366 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  46.15 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  38.2 
 
 		 493 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  37.5 
 
 		 475 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  35.14 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  34.83 
 
 		 382 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  30.21 
 
 		 392 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  35.14 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  39.53 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  36.76 
 
 		 572 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  37.65 
 
 		 347 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  38.82 
 
 		 351 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 368 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  33.78 
 
 		 405 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  30.67 
 
 		 413 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  37.5 
 
 		 346 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 378 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  36.47 
 
 		 347 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  36.26 
 
 		 362 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  35.19 
 
 		 324 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  37.08 
 
 		 402 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  36.59 
 
 		 423 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.38 
 
 		 381 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  36.92 
 
 		 516 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  36.92 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  36.92 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  35.37 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  37.65 
 
 		 348 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 347 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>