More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1929 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  100 
 
 		 154 aa  313  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  73.1 
 
 		 149 aa  223  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  73.1 
 
 		 149 aa  223  9e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  74.15 
 
 		 148 aa  218  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  59.59 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  58.27 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  49.3 
 
 		 143 aa  151  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  45.83 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  41.26 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  43.75 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  42.75 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  41.3 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  46.4 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  40.71 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  41.3 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  39.13 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  38.85 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  46.51 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  39.55 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  42.4 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  39.31 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  37.68 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  40.4 
 
 		 173 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  39.74 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  44 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  43.07 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  39.49 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  42.06 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  37.75 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  31.71 
 
 		 184 aa  90.1  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  34.15 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  34.06 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  33.09 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  34.33 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  36.78 
 
 		 423 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0173  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 495 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000303519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  38.37 
 
 		 442 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03397  transcription elongation factor NusA  33.66 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002608  transcription termination protein NusA  33.66 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000346209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  38.37 
 
 		 442 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1122  NusA antitermination factor  32.98 
 
 		 495 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3061  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 499 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000291489  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  37.65 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 495 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1234  transcription elongation factor NusA  31.68 
 
 		 395 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000227935  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 499 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2828  transcription elongation factor NusA  29.51 
 
 		 499 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00193559  hitchhiker  0.00416619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  32.11 
 
 		 405 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1026  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 496 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.152945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 392 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.07 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3347  transcription elongation factor NusA  31 
 
 		 496 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3466  transcription elongation factor NusA  31 
 
 		 496 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  29.52 
 
 		 497 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1029  transcription elongation factor NusA  26.71 
 
 		 499 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0307152  hitchhiker  0.0000658902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 407 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1203  transcription elongation factor NusA  26.71 
 
 		 499 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 497 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  29.79 
 
 		 492 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  30.69 
 
 		 498 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 467 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  29.81 
 
 		 412 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  29.7 
 
 		 495 aa  53.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  29.81 
 
 		 412 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  26.71 
 
 		 499 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1090  transcription elongation factor NusA  26.71 
 
 		 499 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136267  normal  0.0716025 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 497 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 544 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03036  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0536  NusA antitermination factor  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  39.13 
 
 		 362 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3465  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246943  normal  0.841765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  31.48 
 
 		 509 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3653  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3597  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000179276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02987  hypothetical protein  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  31.07 
 
 		 493 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3545  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.929482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  29.51 
 
 		 499 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 468 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0807  transcription elongation factor NusA  31.48 
 
 		 509 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3477  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 467 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3602  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.761318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 534 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  32.43 
 
 		 471 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0529  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000129927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3361  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0352386  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4490  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3992  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000690041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3731  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00415908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  34.78 
 
 		 493 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0960  transcription elongation factor NusA  29.66 
 
 		 499 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  0.179607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3582  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0816  NusA antitermination factor  29.17 
 
 		 499 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.706967  hitchhiker  0.00205757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3476  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.555068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3644  transcription elongation factor NusA  32 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 501 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>