65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1087 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  100 
 
 		 141 aa  283  5e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  38.03 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  34.51 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  37.32 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  31.91 
 
 		 154 aa  86.7  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  29.29 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  31.43 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  33.1 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  34.33 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  32.59 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  32.39 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  32.39 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  31.11 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  30.66 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  27.69 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  31.11 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  28.06 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  31.43 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  29.08 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  29.37 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  30.53 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  32.26 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  29.86 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  29.71 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  27.78 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  23.61 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  27.27 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  25.55 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  30.4 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  22.22 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  28.23 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  27.87 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  24.07 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  40.23 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 413 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 405 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  27.47 
 
 		 441 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  37.66 
 
 		 380 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  32.18 
 
 		 401 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  28.41 
 
 		 402 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  32.5 
 
 		 429 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  30.68 
 
 		 405 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  32.18 
 
 		 369 aa  40.4  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  31.03 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 443 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>