90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2095 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 144 aa  284  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  89.58 
 
 		 144 aa  265  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  88.19 
 
 		 144 aa  260  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  86.11 
 
 		 144 aa  259  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  60.29 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  51.05 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  45.99 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  51.75 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  42.14 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  41.26 
 
 		 143 aa  120  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  39.16 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  39.16 
 
 		 149 aa  116  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  44.06 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  42.75 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  40.28 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  38.57 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  39.72 
 
 		 142 aa  93.6  8e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.13 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  35.66 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  31.54 
 
 		 147 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  35.38 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  34.27 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  34.62 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  35.17 
 
 		 146 aa  84  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  33.08 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  30.3 
 
 		 166 aa  72  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  34.78 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  34.78 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  34.06 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  32.09 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  29.86 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 344 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 344 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  34.78 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  31.63 
 
 		 401 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  36.78 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  30.43 
 
 		 402 aa  46.2  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1748  transcription elongation factor NusA  36.47 
 
 		 380 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 344 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  32.61 
 
 		 497 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  32.61 
 
 		 497 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 329 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 344 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  31.18 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 485 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  30.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 442 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  27.38 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 421 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 471 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  35.63 
 
 		 373 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  28.23 
 
 		 366 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  32.61 
 
 		 362 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  30.93 
 
 		 337 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  31.63 
 
 		 351 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 405 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 481 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 362 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  37.25 
 
 		 548 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  27.42 
 
 		 366 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 484 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_002950  PG0254  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 444 aa  41.2  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  30.67 
 
 		 545 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0831  NusA antitermination factor  33.67 
 
 		 413 aa  41.6  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000351407  hitchhiker  0.000000535814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 536 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  32.56 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  29.17 
 
 		 333 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  28.12 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  35.85 
 
 		 545 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  35.85 
 
 		 536 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  35.85 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  35.85 
 
 		 545 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 467 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 378 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  35.85 
 
 		 560 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  29.9 
 
 		 344 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7749  NusA antitermination factor  28.87 
 
 		 324 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  34.88 
 
 		 493 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  33.96 
 
 		 532 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  29.67 
 
 		 467 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 382 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 339 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  26.88 
 
 		 393 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  36.96 
 
 		 538 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.22 
 
 		 423 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>