116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0353 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  42.14 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  42.86 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  46.81 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  38.57 
 
 		 143 aa  120  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  40.71 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  41.43 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  40.71 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  38.41 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  38.41 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  39.57 
 
 		 143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  40.14 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  41.73 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  40.71 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  37.86 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  40 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  37.14 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  41.01 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  36.69 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  35.51 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  32.67 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  35.51 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  36.81 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  31.91 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  33.33 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  32.61 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  34.92 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  32.93 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  34.27 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  33.59 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  31.43 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  30.34 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  30 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  29.71 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  27 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2151  transcription termination factor NusA  30.71 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  31.58 
 
 		 326 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  30 
 
 		 538 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  29.47 
 
 		 329 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  28.07 
 
 		 391 aa  47.8  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  32.29 
 
 		 380 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1742  transcription elongation factor NusA  27.08 
 
 		 355 aa  47.4  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  28.95 
 
 		 383 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1410  NusA antitermination factor  28.04 
 
 		 381 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  30.39 
 
 		 346 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  31.91 
 
 		 328 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 353 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0284  transcription termination factor NusA  26.04 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  28.43 
 
 		 344 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  28.43 
 
 		 344 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  30.53 
 
 		 326 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  28.97 
 
 		 433 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  31.31 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  30.11 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 354 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  30.11 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  27.59 
 
 		 395 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  30.19 
 
 		 337 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  28.07 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1180  NusA antitermination factor  29.47 
 
 		 361 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00193855  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  27 
 
 		 405 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  29.17 
 
 		 365 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  28.87 
 
 		 366 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  29.36 
 
 		 365 aa  44.3  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  30.21 
 
 		 373 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  27.45 
 
 		 365 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  27.08 
 
 		 366 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  28.12 
 
 		 503 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  29.17 
 
 		 365 aa  43.9  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0985  transcription elongation factor NusA  31.31 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00150789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  30.11 
 
 		 331 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  28.32 
 
 		 473 aa  43.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  29.63 
 
 		 423 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  23.08 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  29.03 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  29.79 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  27.08 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  29.52 
 
 		 348 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  29.03 
 
 		 357 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  27.08 
 
 		 402 aa  43.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2204  transcription elongation factor NusA  29.41 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000400476  decreased coverage  0.000554149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  27.08 
 
 		 407 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_857  transcription elongation factor  31.31 
 
 		 487 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000272174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3192  transcription elongation factor NusA  29.47 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0218268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  28.16 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  29.03 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  28.28 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  30.53 
 
 		 333 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  25.77 
 
 		 413 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  28.87 
 
 		 391 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  28.87 
 
 		 391 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  28.57 
 
 		 475 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 358 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  27 
 
 		 354 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  27.84 
 
 		 557 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  27.08 
 
 		 442 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>