259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3689 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 141 aa  284  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  63.83 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  58.04 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  42.96 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  41.96 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  41.96 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  45.83 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  42.34 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  44.06 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.86 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  39.31 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  39.46 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  38.46 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  37.76 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  37.86 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  37.04 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  37.06 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  35.37 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  42.52 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  39.37 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  36.69 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  36.62 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  43.31 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  36.76 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  39.06 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  34.11 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  37.8 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  34.53 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  31.43 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  39.74 
 
 		 347 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  41.03 
 
 		 348 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  37.18 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1414  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0386323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  32.65 
 
 		 441 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  35.9 
 
 		 365 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 333 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1425  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000324988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0262  transcription elongation factor NusA  39.08 
 
 		 366 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  35.9 
 
 		 344 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 337 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1441  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 339 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 572 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  37.18 
 
 		 337 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  31.96 
 
 		 392 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  34.62 
 
 		 333 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  36.71 
 
 		 354 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 383 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 506 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0427  transcription termination factor NusA  36.78 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  38.46 
 
 		 358 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 347 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 347 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1325  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10300  transcription termination factor NusA  35.9 
 
 		 328 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.25441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 347 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2491  NusA antitermination factor  37.04 
 
 		 346 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  34.18 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 468 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 471 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 333 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  36.56 
 
 		 362 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 497 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 373 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 497 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  36.71 
 
 		 372 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  33.72 
 
 		 538 aa  50.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14550  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 348 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0106294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 516 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  37.5 
 
 		 537 aa  49.7  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 535 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  35.9 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 413 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 467 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 467 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0336  transcription elongation factor NusA  36.56 
 
 		 558 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  35.05 
 
 		 524 aa  48.9  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  30.11 
 
 		 402 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  29.79 
 
 		 391 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16721  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 467 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 552 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  35.9 
 
 		 357 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl292  transcription elongation factor NusA  35.48 
 
 		 471 aa  48.5  0.00003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.113528  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 485 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3564  NusA antitermination factor  35.9 
 
 		 365 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0133345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  33.75 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 538 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 484 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1368  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 347 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219498  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 537 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  35.44 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>