109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0212 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 173 aa  342  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  97.11 
 
 		 173 aa  333  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  95.95 
 
 		 173 aa  333  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  91.33 
 
 		 173 aa  317  6e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  59.2 
 
 		 184 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  38.24 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  39.74 
 
 		 154 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 141 aa  97.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  38.85 
 
 		 142 aa  97.4  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  39.13 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  36.43 
 
 		 143 aa  90.5  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.96 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  36.23 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  36.23 
 
 		 149 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  30 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  34.31 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  35.04 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  35.11 
 
 		 144 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  32.5 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  34.75 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  31.11 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  34.35 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  34.06 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  28.37 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  30.5 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  29.93 
 
 		 146 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  39.08 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  39.44 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  32.61 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  28.26 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  29.57 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 524 aa  52  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  23.95 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 362 aa  49.7  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 401 aa  47.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 358 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  31.82 
 
 		 365 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 471 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 341 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 329 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 481 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  32.5 
 
 		 337 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 373 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 485 aa  44.7  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  32.48 
 
 		 385 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  30.89 
 
 		 333 aa  44.3  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 484 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0784  PhoH family protein  36.51 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0304988  normal  0.163823 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 497 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 333 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  30.77 
 
 		 497 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 353 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  36.26 
 
 		 347 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 344 aa  43.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 383 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  39.58 
 
 		 351 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  43.75 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 407 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 468 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 344 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  28.69 
 
 		 482 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2559  transcription termination factor NusA  29.55 
 
 		 442 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 501 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  39.58 
 
 		 354 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 385 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 520 aa  41.6  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  25 
 
 		 493 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 423 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  31.06 
 
 		 537 aa  41.6  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  29.03 
 
 		 392 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 467 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  27.27 
 
 		 442 aa  41.6  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  41.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 493 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  26.87 
 
 		 383 aa  41.6  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  46.67 
 
 		 537 aa  41.6  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  27.27 
 
 		 442 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 495 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  41.67 
 
 		 348 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  34.65 
 
 		 545 aa  41.2  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  31.09 
 
 		 537 aa  41.2  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  26.14 
 
 		 494 aa  40.8  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 495 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  26.14 
 
 		 494 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  31.68 
 
 		 534 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  30.34 
 
 		 548 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  31.09 
 
 		 537 aa  41.2  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  26.14 
 
 		 393 aa  40.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>