205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0780 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 142 aa  270  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  56.03 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  53.9 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  50.68 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  45.18 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  37.21 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.69 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  40.43 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  32.85 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  39.72 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  36.69 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  35.25 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  39.57 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  39.72 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  36.17 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  36.88 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  34.75 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  34.75 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  33.09 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  35.56 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  37.59 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  35.42 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  35.04 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  37.14 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  31.39 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  30.66 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  31.21 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  30.6 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  30.22 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  30.5 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  30.5 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  30.5 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 405 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  43.01 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 412 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 442 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  36.84 
 
 		 412 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  34.74 
 
 		 442 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  35.42 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  33.03 
 
 		 423 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  30.93 
 
 		 341 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 362 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  36.56 
 
 		 493 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  34.02 
 
 		 362 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  31.58 
 
 		 442 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  33.33 
 
 		 401 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  31.18 
 
 		 366 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3978  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 426 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0597  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 425 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  34.41 
 
 		 444 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  30.11 
 
 		 366 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  31.96 
 
 		 484 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  31.58 
 
 		 346 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 368 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1870  transcription elongation factor NusA  33.68 
 
 		 425 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0338144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  36.56 
 
 		 405 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 475 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  34.65 
 
 		 495 aa  46.6  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1730  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  34.41 
 
 		 552 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  33.68 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  32.99 
 
 		 378 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  36.96 
 
 		 358 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  34.59 
 
 		 329 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  31.18 
 
 		 382 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  38.04 
 
 		 344 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  33.68 
 
 		 365 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  35.11 
 
 		 503 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  33.01 
 
 		 491 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  32.04 
 
 		 491 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>