115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0676 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  91.91 
 
 		 173 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  91.33 
 
 		 173 aa  318  3e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  91.33 
 
 		 173 aa  317  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  60.37 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  39.71 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 141 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  38.85 
 
 		 142 aa  95.9  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  40.58 
 
 		 148 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  37.75 
 
 		 154 aa  94.4  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 141 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  37.86 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  39.13 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  37.59 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  37.59 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  38.14 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  32.59 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  29.71 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  31.43 
 
 		 139 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  34.17 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  31.21 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  29.79 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  39.44 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  35.11 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  39.77 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  34.35 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  32.61 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  27.89 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  28.99 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  29.57 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  25.75 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  34.41 
 
 		 358 aa  51.2  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  35.11 
 
 		 401 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 524 aa  50.4  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 481 aa  48.9  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0784  PhoH family protein  34.51 
 
 		 371 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0304988  normal  0.163823 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 362 aa  47.8  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  32.73 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 485 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0883  PhoH family protein  33.33 
 
 		 370 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 383 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 385 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  32.22 
 
 		 383 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  32.22 
 
 		 382 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  31.54 
 
 		 520 aa  45.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 484 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.06 
 
 		 471 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  34.07 
 
 		 329 aa  44.7  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  31.46 
 
 		 538 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 497 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  32.29 
 
 		 468 aa  44.3  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  34.74 
 
 		 497 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 381 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  30.85 
 
 		 373 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 501 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  29.57 
 
 		 405 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  32.26 
 
 		 406 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  29.89 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1769  PhoH family protein  30.56 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.192985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 341 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  31.97 
 
 		 333 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 407 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  31.82 
 
 		 492 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 498 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16961  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 467 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  32.29 
 
 		 467 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  32.29 
 
 		 344 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0957  NusA antitermination factor  29.35 
 
 		 431 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  37.25 
 
 		 482 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  30.34 
 
 		 372 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 541 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  32.97 
 
 		 337 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 333 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 347 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 353 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  32.29 
 
 		 344 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2089  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 413 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 539 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 493 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  23.85 
 
 		 493 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  38 
 
 		 351 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 495 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 537 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  26.14 
 
 		 442 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  27.96 
 
 		 392 aa  41.6  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  28.44 
 
 		 383 aa  41.6  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 538 aa  41.2  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 540 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  27.52 
 
 		 391 aa  41.6  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0884  KH domain-containing protein  31.73 
 
 		 378 aa  41.2  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.145577  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2115  PhoH family protein  31.31 
 
 		 371 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>