74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0511 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 141 aa  274  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  55.17 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  56.74 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  56.03 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  48.81 
 
 		 166 aa  143  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  41.18 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  41.73 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  37.04 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  38.13 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  39.55 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  36.88 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  39.16 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  36.36 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  36.36 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  39.86 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  37.86 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  32.14 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  35.51 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  35.66 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  32.14 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  37.41 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  32.35 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  34.85 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  32.35 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  32.28 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  30.56 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  34.75 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  34.04 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  34.04 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  25.55 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  35.79 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  35.23 
 
 		 347 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  33.71 
 
 		 401 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08060  transcription termination factor NusA  35.96 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0969065  normal  0.170976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 362 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1209  NusA antitermination factor  32.95 
 
 		 344 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1059  NusA antitermination factor  31.82 
 
 		 333 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00843571  normal  0.0553593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  33.73 
 
 		 392 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 366 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 366 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3391  transcription elongation factor NusA  38.98 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5836  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2712  transcription elongation factor NusA  38.98 
 
 		 412 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1713  NusA antitermination factor  36.36 
 
 		 333 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  32.95 
 
 		 329 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  35.23 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23470  transcription termination factor NusA  34.09 
 
 		 365 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.156847  normal  0.0534331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0488  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 502 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.573333  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11460  transcription termination factor NusA  30.37 
 
 		 357 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00403363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  34.09 
 
 		 347 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2816  transcription elongation factor NusA  28.15 
 
 		 503 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  33.85 
 
 		 441 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  35.59 
 
 		 405 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 333 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3594  NusA antitermination factor  32.95 
 
 		 337 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1379  transcription elongation factor NusA  37.8 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2115  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  30.34 
 
 		 384 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 353 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  37.29 
 
 		 475 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  34.69 
 
 		 358 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 381 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1517  transcription elongation factor NusA  35.23 
 
 		 348 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  32.58 
 
 		 423 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0807  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 509 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12856  transcription elongation factor NusA  35.56 
 
 		 347 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000023411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0584  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 509 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>