104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1307 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  97.69 
 
 		 173 aa  336  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  97.11 
 
 		 173 aa  333  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  91.91 
 
 		 173 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  56.82 
 
 		 184 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  38.97 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  40.4 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.57 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  36.3 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  39.86 
 
 		 148 aa  94  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  37.14 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  39.84 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  37.68 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  36.96 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  36.96 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  31.43 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  35.9 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  33.33 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  31.11 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  35.88 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  30.94 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  35.11 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  34.04 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  34.78 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  37.93 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  29.08 
 
 		 148 aa  67.4  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  30.5 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  29.25 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  38.03 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  27.54 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  28.7 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  24.55 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 524 aa  51.6  0.000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2318  NusA antitermination factor  34.41 
 
 		 358 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00819018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1358  transcription elongation factor  32.73 
 
 		 365 aa  47.8  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.946051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  30.85 
 
 		 401 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  32.26 
 
 		 362 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  31.46 
 
 		 391 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0784  PhoH family protein  39.34 
 
 		 371 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0304988  normal  0.163823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  31.91 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.3 
 
 		 471 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  31.82 
 
 		 341 aa  45.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2079  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 481 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.376983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  28.69 
 
 		 482 aa  44.7  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  31.62 
 
 		 385 aa  44.3  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1319  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 520 aa  43.9  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0594  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 485 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 344 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  36.54 
 
 		 433 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 407 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  31.52 
 
 		 406 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 541 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  30.68 
 
 		 501 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04151  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 484 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0883  PhoH family protein  36.67 
 
 		 370 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  32.32 
 
 		 344 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 538 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 539 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  43.18 
 
 		 537 aa  42.4  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  35.16 
 
 		 347 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 540 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 536 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  30.34 
 
 		 548 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0820  transcription elongation factor NusA  25 
 
 		 493 aa  42.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  29.03 
 
 		 392 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01302  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 495 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.30262  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 537 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 383 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 382 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1023  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 497 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  31.82 
 
 		 492 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1585  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 468 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 495 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18931  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 497 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  29.55 
 
 		 537 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 493 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  26.14 
 
 		 494 aa  41.6  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  26.14 
 
 		 393 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  26.14 
 
 		 494 aa  41.6  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  34.65 
 
 		 545 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  31.82 
 
 		 538 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  27.61 
 
 		 383 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  37.5 
 
 		 329 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1949  transcription elongation factor NusA  30 
 
 		 498 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.0311483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  31.68 
 
 		 572 aa  41.2  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16831  transcription elongation factor NusA  30.53 
 
 		 467 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2359  transcription elongation factor NusA  29.79 
 
 		 405 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1018  NusA antitermination factor  37.5 
 
 		 354 aa  41.2  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0430  transcription elongation factor  30 
 
 		 473 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.2178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  29.09 
 
 		 498 aa  40.8  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  29.55 
 
 		 557 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0380  transcription elongation factor NusA  27.52 
 
 		 391 aa  40.8  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.078834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  29.55 
 
 		 557 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  29.55 
 
 		 557 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>