206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0791 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  66.44 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  65.31 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  58.87 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  58.45 
 
 		 146 aa  172  9e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  46.46 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  39.86 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  39.86 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  34.88 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  44 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  42.65 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  37.8 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  41.35 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  36.81 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  36.43 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  37.59 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  37.1 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  33.59 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  33.58 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  32.48 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  33.59 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  33.08 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  34.85 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  39.6 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  31.01 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  34.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  31.75 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  39.44 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  39.44 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  29.52 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  38.03 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  38.03 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  39.44 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.04 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  30.71 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  30.71 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1062  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1914  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2565  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00130089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1756  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.661093  normal  0.0375978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2821  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00148151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1508  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0176  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0109764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1739  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0423315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1761  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0990  transcription elongation factor NusA  25.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0472282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1631  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4640  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0433765  normal  0.822705 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0521  N utilization substance protein A  30.85 
 
 		 537 aa  52.8  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1019  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.974468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1381  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1499  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0985088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1421  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  24.27 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1475  transcription elongation factor NusA  25.93 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  29.79 
 
 		 368 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  30.84 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  25.98 
 
 		 491 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  34.04 
 
 		 341 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  32.32 
 
 		 357 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  25.98 
 
 		 491 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  29.29 
 
 		 368 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 557 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 557 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  32.91 
 
 		 557 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09350  transcription termination factor NusA  28.72 
 
 		 401 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000834112  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  32.94 
 
 		 556 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  26.02 
 
 		 495 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  26.92 
 
 		 495 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  30.51 
 
 		 423 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  25.2 
 
 		 491 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  24.41 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  24.47 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  24.47 
 
 		 545 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  24.47 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  24.47 
 
 		 560 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  30.23 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  27.88 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  32.98 
 
 		 347 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  28.28 
 
 		 366 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  28.24 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  30.19 
 
 		 498 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  29.25 
 
 		 506 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  30.19 
 
 		 506 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  27.87 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  23.4 
 
 		 544 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  23.4 
 
 		 536 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  24.41 
 
 		 491 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1812  NusA antitermination factor  29.79 
 
 		 405 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.768572  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  32.94 
 
 		 538 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>