216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2073 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2073  NusA family protein  100 
 
 		 147 aa  288  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.115145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0437  NusA family KH domain protein  73.97 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0231371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0791  NusA family protein  66.44 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.013566  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1385  hypothetical protein  62.24 
 
 		 151 aa  189  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1778  NusA family protein  62.41 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0303  NusA family protein  44.85 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.212919  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0317  NusA family protein  44.85 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0703108  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2164  NusA family KH domain protein  53.28 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0209393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1929  NusA family protein  46.51 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3689  transcription elongation factor NusA-like protein  42.52 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.167967 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0032  NusA family protein  40.88 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0353  NusA family protein  41.01 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0373  aminotransferase, class I and II  44.35 
 
 		 157 aa  95.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1200  NusA family KH domain protein  34.88 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2325  transcription elongation factor NusA-like protein  36.15 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000411828  decreased coverage  0.00000148869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1174  transcription elongation factor NusA-like protein  42.98 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000440347  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0699  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00857549  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1967  transcription elongation factor NusA-like protein  35.04 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000104424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2095  transcription elongation factor NusA-like protein  35.38 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0055  NusA family protein  42.72 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0321  transcription elongation factor NusA-like protein  33.85 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.140806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0780  transcription elongation factor NusA-like protein  35.42 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0698378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0511  transcription elongation factor NusA-like protein  32.35 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0103  transcription elongation factor NusA-like protein  33.07 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0037  transcription elongation factor NusA-like protein  37.4 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000224532  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0611  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0676  transcription elongation factor NusA-like protein  34.17 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.618289  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1307  transcription elongation factor NusA-like protein  33.33 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0355  NusA family KH domain protein  29.55 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0212  transcription elongation factor NusA-like protein  32.5 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2154  NusA family KH domain protein  30.38 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.392185  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0282  NusA family protein  33.04 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.956097  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0786  transcription elongation factor NusA-like protein  32.2 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1087  NusA family KH domain protein  30.4 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.513028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  30.43 
 
 		 491 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  35.42 
 
 		 393 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  34.38 
 
 		 423 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0772  NusA antitermination factor  38.14 
 
 		 362 aa  51.6  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  33.33 
 
 		 373 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  28.23 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  30.49 
 
 		 369 aa  48.9  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  31.73 
 
 		 495 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  32.71 
 
 		 380 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1094  transcription elongation factor NusA  29.7 
 
 		 493 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1700  NusA antitermination factor  31.25 
 
 		 492 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1228  transcription elongation factor NusA  29.7 
 
 		 493 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00625796  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  35.71 
 
 		 392 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2747  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 494 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  34.04 
 
 		 493 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0068  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 494 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.272639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0073  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 494 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.837556  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3384  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 494 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0163394  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  34.88 
 
 		 506 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2750  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 494 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504995  normal  0.0950252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2989  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 495 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416264  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1288  transcription elongation factor NusA  27.59 
 
 		 491 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1246  NusA antitermination factor  30.43 
 
 		 494 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0519661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  28.74 
 
 		 362 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2562  NusA antitermination factor  30.43 
 
 		 494 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0312455  hitchhiker  0.00289599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1419  NusA antitermination factor  31.4 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2133  NusA antitermination factor  31.43 
 
 		 498 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.502906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2080  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2126  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312035  normal  0.0121044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1750  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 501 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.844805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2063  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 347 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  29.81 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  29.81 
 
 		 503 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2012  NusA antitermination factor  31.52 
 
 		 506 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000880424  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  31.91 
 
 		 382 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  36.05 
 
 		 538 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  35.9 
 
 		 365 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  32.56 
 
 		 442 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  31.25 
 
 		 490 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0776  transcription elongation factor NusA  32.56 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2022  transcription elongation factor NusA  36.14 
 
 		 441 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.142374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  27.88 
 
 		 516 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  30.21 
 
 		 488 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1209  transcription elongation factor NusA  27.59 
 
 		 491 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1049  NusA antitermination factor  41.98 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1116  transcription elongation factor NusA  27.59 
 
 		 491 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.749384 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1468  NusA antitermination factor  28.26 
 
 		 491 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0601103  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf784  transcription elongation factor NusA  36.05 
 
 		 524 aa  46.2  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1922  NusA antitermination factor  31.4 
 
 		 492 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208405 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0178  transcription elongation factor NusA  31.13 
 
 		 503 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.125443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1865  transcription elongation factor NusA  27.91 
 
 		 495 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.253606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2709  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 493 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0202  transcription elongation factor NusA  31.13 
 
 		 503 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.504361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2312  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.0487624 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 341 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  30.23 
 
 		 544 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2425  NusA antitermination factor  30.43 
 
 		 506 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000562867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2032  transcription elongation factor NusA  25.86 
 
 		 491 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395424  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  27.88 
 
 		 532 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  32.05 
 
 		 383 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4041  transcription elongation factor NusA  31.4 
 
 		 353 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00507131  normal  0.461903 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16141  transcription elongation factor NusA  31.65 
 
 		 471 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  31.43 
 
 		 395 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0156  transcription elongation factor NusA  28.26 
 
 		 495 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  30.77 
 
 		 382 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>