More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0336 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0336  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 558 aa  1097    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl292  transcription elongation factor NusA  53.78 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.113528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  39.54 
 
 		 383 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  38.97 
 
 		 382 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  40.18 
 
 		 373 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  37.65 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  39 
 
 		 381 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  38.54 
 
 		 368 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  39.83 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.9 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  38.48 
 
 		 368 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  39.18 
 
 		 404 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  38.27 
 
 		 368 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  35.48 
 
 		 544 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  39.42 
 
 		 346 aa  234  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  37.18 
 
 		 493 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  38.3 
 
 		 365 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  38.97 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  35.78 
 
 		 535 aa  232  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  34.6 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  35.19 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  35.19 
 
 		 545 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  34.9 
 
 		 560 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  35.78 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  35.78 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  36.36 
 
 		 531 aa  229  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.88 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  35.19 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  34.31 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  34.9 
 
 		 535 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  34.31 
 
 		 534 aa  226  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  34.31 
 
 		 545 aa  226  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  36.18 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  36.13 
 
 		 544 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  36.66 
 
 		 384 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  35.84 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  35.55 
 
 		 534 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  40.18 
 
 		 344 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  38.33 
 
 		 354 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  34.02 
 
 		 538 aa  223  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  34.9 
 
 		 537 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  36.45 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  39.58 
 
 		 344 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  36.42 
 
 		 572 aa  220  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  38.42 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  34.68 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  34.68 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  34.68 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  37.28 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  34.39 
 
 		 537 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  34.4 
 
 		 536 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  34.69 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  35.28 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  34.48 
 
 		 537 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  36.66 
 
 		 359 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  34.68 
 
 		 539 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  34.68 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  36.2 
 
 		 383 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  36.2 
 
 		 382 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  33.33 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  34.97 
 
 		 568 aa  210  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0833  transcription elongation factor NusA  36.21 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.792423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  32.54 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  35.91 
 
 		 383 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1326  transcription elongation factor NusA  34.43 
 
 		 391 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  35.06 
 
 		 392 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1352  transcription elongation factor NusA  34.43 
 
 		 391 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  34.32 
 
 		 523 aa  207  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0814  transcription elongation factor NusA  35.91 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  35.29 
 
 		 385 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  36.23 
 
 		 503 aa  204  5e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  34.4 
 
 		 423 aa  203  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 544 aa  203  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  32.85 
 
 		 492 aa  203  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3562  transcription elongation factor NusA  34.39 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.490076  decreased coverage  0.000000857333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.63 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  34.3 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0632  transcription termination factor NusA  34.5 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  35.93 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  32.27 
 
 		 495 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3390  transcription elongation factor NusA  34.58 
 
 		 499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181989  hitchhiker  0.00101946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  34.19 
 
 		 444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2828  transcription elongation factor NusA  34.59 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00193559  hitchhiker  0.00416619 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0378  transcription elongation factor NusA  36.11 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.138784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  32.18 
 
 		 475 aa  199  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  36.92 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0530  transcription elongation factor NusA  34.32 
 
 		 341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0996  NusA antitermination factor  35.57 
 
 		 369 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000936712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  33.05 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1002  transcription elongation factor NusA  32.75 
 
 		 501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1025  transcription elongation factor NusA  33.43 
 
 		 499 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00167997  hitchhiker  0.00000356504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>