More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1627 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1627  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0884036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0572  NusA antitermination factor  39.84 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0763996  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  35.82 
 
 		 449 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.93 
 
 		 538 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0636  NusA antitermination factor  34.71 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  43.95 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  43.95 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  42.74 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  41.34 
 
 		 441 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  34.63 
 
 		 536 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  34.33 
 
 		 532 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  40.25 
 
 		 536 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  34.42 
 
 		 535 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  41.49 
 
 		 516 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  41.15 
 
 		 534 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  40.74 
 
 		 537 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  40.74 
 
 		 537 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 557 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 557 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  35.29 
 
 		 557 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  34.63 
 
 		 544 aa  195  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  40.33 
 
 		 548 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  39.53 
 
 		 556 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  39.83 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  39.83 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  40.08 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  40.25 
 
 		 545 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  39.83 
 
 		 560 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  39.59 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  35.59 
 
 		 537 aa  193  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  39.76 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  40.89 
 
 		 380 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 538 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 535 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  40.5 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  35.59 
 
 		 381 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 533 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 572 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  40.16 
 
 		 559 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  39.61 
 
 		 449 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  39.51 
 
 		 552 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  39.51 
 
 		 540 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2559  transcription termination factor NusA  37.22 
 
 		 442 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 535 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 534 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  38.68 
 
 		 531 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 535 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 443 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  40.25 
 
 		 537 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  40.32 
 
 		 429 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 539 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  37.27 
 
 		 404 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  31.5 
 
 		 491 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  33.52 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  34.62 
 
 		 385 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  39.59 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  33.14 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  38.68 
 
 		 538 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  38.82 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  39.18 
 
 		 538 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3332  NusA antitermination factor  35.81 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166447  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  39 
 
 		 544 aa  185  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  39.09 
 
 		 537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  33.72 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  39.51 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  39.37 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 383 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  37.76 
 
 		 544 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 590 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  39.84 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  40.32 
 
 		 493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3421  transcription elongation factor NusA  38.96 
 
 		 418 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3281  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 		 499 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000185934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3418  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 		 499 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000438946  hitchhiker  0.000891299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  40.16 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1127  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 		 499 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000246453  unclonable  0.00000000000839394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  37.9 
 
 		 538 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3240  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 		 499 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.001866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  38.31 
 
 		 354 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0698  NusA antitermination factor  29.6 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.10534  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  31.01 
 
 		 490 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2835  transcription elongation factor NusA  35.71 
 
 		 499 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1026  NusA antitermination factor  32.08 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.152945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  37.45 
 
 		 529 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  39.17 
 
 		 523 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  33.05 
 
 		 498 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  32.38 
 
 		 493 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  37.86 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  32.38 
 
 		 493 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  41.22 
 
 		 360 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  37.96 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  39.17 
 
 		 506 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  35.36 
 
 		 373 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  37.98 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  37.45 
 
 		 495 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  32.09 
 
 		 493 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  35.83 
 
 		 488 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1694  NusA antitermination factor  32.48 
 
 		 497 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  37.69 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  32.28 
 
 		 497 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>