More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2310 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1545  putative extracellular solute-binding protein  62.92 
 
 		 606 aa  774    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.0971522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  55.97 
 
 		 604 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2310  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 603 aa  1230    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0736306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1343  extracellular solute-binding protein  56.63 
 
 		 609 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  54.28 
 
 		 603 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  53.17 
 
 		 603 aa  628  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0931  extracellular solute-binding protein  54.1 
 
 		 618 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  42.73 
 
 		 640 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2274  extracellular solute-binding protein  41.89 
 
 		 600 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1917  extracellular solute-binding protein family 5  39.54 
 
 		 601 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1397  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 606 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982775  normal  0.886089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3826  extracellular solute-binding protein family 5  40.14 
 
 		 610 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2194  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 606 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1733  extracellular solute-binding protein family 5  39.27 
 
 		 600 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.197004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2050  extracellular solute-binding protein  42.4 
 
 		 620 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2941  extracellular solute-binding protein family 5  41.17 
 
 		 626 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  38.45 
 
 		 633 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2847  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 623 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  40.91 
 
 		 601 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1510  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 620 aa  412  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14042  normal  0.0541168 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0542  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.07 
 
 		 616 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3638  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 		 592 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1699  extracellular solute-binding protein  38.35 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.07 
 
 		 615 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2370  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  37.61 
 
 		 615 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2625  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 		 610 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15211  decreased coverage  0.0000486729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 621 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  39.59 
 
 		 670 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  37.93 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  37.74 
 
 		 607 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 		 615 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  36.82 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  38.05 
 
 		 658 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  35.99 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  37.02 
 
 		 615 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0248  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 626 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 611 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 		 615 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0378  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 		 659 aa  362  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 631 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 		 627 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 611 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.95 
 
 		 614 aa  360  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 		 613 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  36.2 
 
 		 611 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 611 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.91 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 609 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2613  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 604 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.674629  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  35.41 
 
 		 609 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1758  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 618 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316004  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.01 
 
 		 614 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  37.97 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 597 aa  350  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  38.27 
 
 		 631 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0515  extracellular solute-binding protein family 5  38.15 
 
 		 626 aa  349  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3717  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.97 
 
 		 618 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1615  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 627 aa  347  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  36.3 
 
 		 625 aa  346  8e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 635 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3729  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  37.25 
 
 		 631 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0015  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 622 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3640  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 		 615 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.133111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  35.67 
 
 		 628 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 		 621 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3358  extracellular solute-binding protein  35.24 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0726814  normal  0.160875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 610 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1014  extracellular solute-binding protein family 5  35.46 
 
 		 628 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.517437  normal  0.0342428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 632 aa  340  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3728  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 		 621 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0421  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 		 641 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  34.2 
 
 		 622 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 637 aa  337  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.97 
 
 		 610 aa  336  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 626 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  36.61 
 
 		 637 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.47 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 641 aa  334  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 		 628 aa  333  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 625 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 638 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 		 619 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 624 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  35.55 
 
 		 622 aa  330  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  36.19 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0422  extracellular solute-binding protein family 5  35.43 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  35.75 
 
 		 627 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3914  extracellular solute-binding protein family 5  36.02 
 
 		 630 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29640  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  34.97 
 
 		 609 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.34 
 
 		 650 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.62 
 
 		 623 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 627 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0343  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 624 aa  323  7e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  34.27 
 
 		 626 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>