More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0194 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0194  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
691 aa  1355    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.122239  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.74 
 
 
737 aa  165  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.37 
 
 
723 aa  165  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.2 
 
 
781 aa  163  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  42.54 
 
 
722 aa  163  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.86 
 
 
763 aa  162  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.88 
 
 
738 aa  161  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.34 
 
 
784 aa  161  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.06 
 
 
739 aa  160  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.74 
 
 
754 aa  160  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.28 
 
 
737 aa  160  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.2 
 
 
757 aa  160  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.26 
 
 
808 aa  160  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.43 
 
 
768 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.34 
 
 
800 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.34 
 
 
754 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.91 
 
 
781 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  40 
 
 
804 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.83 
 
 
760 aa  159  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.74 
 
 
742 aa  159  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.75 
 
 
852 aa  159  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.04 
 
 
727 aa  158  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  41.63 
 
 
703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.49 
 
 
732 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.77 
 
 
754 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.63 
 
 
736 aa  157  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.1 
 
 
718 aa  157  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.95 
 
 
736 aa  156  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  40.34 
 
 
810 aa  156  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.74 
 
 
738 aa  156  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.18 
 
 
754 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.06 
 
 
742 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.46 
 
 
740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  42.45 
 
 
713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  38.89 
 
 
810 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.16 
 
 
731 aa  154  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  40.08 
 
 
754 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.77 
 
 
738 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.16 
 
 
731 aa  154  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.06 
 
 
743 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.42 
 
 
772 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.03 
 
 
740 aa  153  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  38.55 
 
 
394 aa  152  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.16 
 
 
731 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.31 
 
 
719 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  38.68 
 
 
412 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  38.52 
 
 
763 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  34.41 
 
 
613 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.13 
 
 
756 aa  151  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  39.48 
 
 
739 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  41.35 
 
 
422 aa  151  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.592005 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  41.56 
 
 
814 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  36.59 
 
 
1284 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.22 
 
 
806 aa  150  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.57 
 
 
731 aa  150  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.88 
 
 
709 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  35.22 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  39.48 
 
 
746 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  38.5 
 
 
769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.25 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.85 
 
 
620 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  37.93 
 
 
387 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  40.08 
 
 
703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  34.41 
 
 
407 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.24 
 
 
701 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.82 
 
 
760 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  40.17 
 
 
732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.09 
 
 
704 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  34.41 
 
 
407 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  37.44 
 
 
715 aa  147  5e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  31.77 
 
 
764 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  37.07 
 
 
663 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.09 
 
 
757 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.97 
 
 
721 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.96 
 
 
735 aa  147  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  37.4 
 
 
1301 aa  146  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  37.5 
 
 
648 aa  146  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  41.74 
 
 
647 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  35.16 
 
 
436 aa  146  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.06 
 
 
753 aa  146  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  38.63 
 
 
775 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.27 
 
 
806 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  38.65 
 
 
663 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.22 
 
 
757 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  34.81 
 
 
386 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.38 
 
 
773 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  36.96 
 
 
620 aa  145  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  37.12 
 
 
632 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  36.91 
 
 
641 aa  144  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.5 
 
 
805 aa  144  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  36.49 
 
 
734 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.53 
 
 
627 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  40.66 
 
 
513 aa  144  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  39.81 
 
 
389 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  37.61 
 
 
697 aa  144  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  41.52 
 
 
829 aa  144  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  38.6 
 
 
413 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.53 
 
 
812 aa  144  7e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  37.99 
 
 
412 aa  144  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  39.91 
 
 
930 aa  144  8e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>