More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1338 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.67 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.12 
 
 
302 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.45 
 
 
307 aa  474  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.46 
 
 
310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.67 
 
 
306 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  60.73 
 
 
305 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.48 
 
 
305 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 
301 aa  338  7e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.81 
 
 
305 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.25 
 
 
326 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.49 
 
 
298 aa  331  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.09 
 
 
304 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.55 
 
 
300 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.14 
 
 
300 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
294 aa  317  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.62 
 
 
302 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.45 
 
 
302 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.85 
 
 
296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 
306 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
303 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  58.33 
 
 
306 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.08 
 
 
303 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.05 
 
 
710 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  59.11 
 
 
303 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  59.11 
 
 
303 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
288 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.17 
 
 
299 aa  258  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.29 
 
 
303 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
287 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
287 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 
287 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
287 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  49.44 
 
 
286 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
913 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  50.18 
 
 
903 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.78 
 
 
305 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
300 aa  235  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  47.64 
 
 
893 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  53.07 
 
 
901 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
313 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
315 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
306 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
306 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
306 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  51.34 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
313 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.45 
 
 
292 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 
309 aa  197  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  45.73 
 
 
305 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 
301 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 
301 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  43.38 
 
 
301 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.76 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
305 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
301 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.44 
 
 
305 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  47.46 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
301 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
306 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
304 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
304 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
324 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  42.98 
 
 
304 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
304 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
301 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
301 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  44.72 
 
 
304 aa  175  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.63 
 
 
247 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
308 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
316 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
324 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
305 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
324 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
324 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
334 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
311 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
301 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
310 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
301 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
317 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.8 
 
 
307 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
317 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
330 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  43.88 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00693631  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 
291 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00337354  hitchhiker  0.000000292198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
312 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
312 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
312 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.339496  normal  0.553858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
301 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
313 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>