More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2673 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
302 aa  613  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.52 
 
 
300 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.64 
 
 
306 aa  333  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.28 
 
 
301 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.3 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  54.49 
 
 
305 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.45 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.45 
 
 
303 aa  320  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.4 
 
 
326 aa  318  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.71 
 
 
307 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
305 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.49 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
302 aa  300  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 
310 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.04 
 
 
296 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.6 
 
 
298 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.11 
 
 
913 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 
710 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
303 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
294 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  45.54 
 
 
306 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.48 
 
 
299 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
287 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 
288 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
287 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 
303 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 
306 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  48.74 
 
 
286 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  46.15 
 
 
303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  45.82 
 
 
303 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 
298 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  48.74 
 
 
901 aa  221  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  45.21 
 
 
903 aa  216  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  44.01 
 
 
893 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
305 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
315 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  47.58 
 
 
292 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
292 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  44.73 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
304 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
309 aa  179  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
301 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
304 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
304 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
307 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00693631  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  40.64 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  42.74 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
313 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 
301 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
303 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 
301 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  42.5 
 
 
301 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
306 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00337354  hitchhiker  0.000000292198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
303 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
306 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
306 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
306 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.31 
 
 
305 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
351 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
301 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  43.88 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.52 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
312 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.339496  normal  0.553858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
305 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
306 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
308 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  42.37 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
317 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
307 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
301 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
301 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
330 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
317 aa  159  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
311 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000504065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
312 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214873  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
312 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.260501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.49 
 
 
246 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
324 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
324 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
324 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
247 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 
292 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
334 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.22 
 
 
247 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>