More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4491 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.24 
 
 
313 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.1 
 
 
315 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.04 
 
 
313 aa  434  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
298 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
299 aa  269  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
305 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.65 
 
 
710 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
913 aa  222  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
300 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
304 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
302 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
288 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
287 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
287 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.11 
 
 
303 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
303 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
324 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
324 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
324 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.4 
 
 
306 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
324 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  42.86 
 
 
303 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  42.86 
 
 
303 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.64 
 
 
286 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 
326 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
303 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
303 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  48.42 
 
 
903 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
305 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
305 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
292 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
291 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  43.17 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
302 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
305 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
304 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
316 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535694  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  42.96 
 
 
901 aa  189  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
309 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
303 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
301 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
311 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  41.97 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.23 
 
 
303 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
300 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
307 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
298 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
296 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  44.75 
 
 
301 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.43 
 
 
305 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
305 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 
301 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 
301 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 
301 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  39.01 
 
 
305 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
351 aa  168  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
302 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
304 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  43.19 
 
 
301 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  47.15 
 
 
293 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  47.67 
 
 
350 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  40.66 
 
 
893 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  42.74 
 
 
304 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  43.2 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
301 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
301 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
301 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 
320 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
301 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
300 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
310 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.45 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
294 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0588577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
317 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
301 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 
290 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
301 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
301 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
301 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>