More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3697 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
313 aa  621  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.99 
 
 
313 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73 
 
 
306 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73 
 
 
306 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73 
 
 
306 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.35 
 
 
315 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.07 
 
 
298 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
299 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
305 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.52 
 
 
324 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149796  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
300 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 
710 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.78 
 
 
913 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.04 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
303 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
288 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  44 
 
 
306 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2572  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.92 
 
 
324 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710215  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.92 
 
 
324 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
305 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.92 
 
 
324 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
287 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
287 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 
287 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
301 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.91 
 
 
287 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
303 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  42.86 
 
 
303 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  42.86 
 
 
303 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.64 
 
 
286 aa  205  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
305 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  43.82 
 
 
305 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
303 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.65 
 
 
303 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
310 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
305 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
303 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 
302 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
304 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  42.01 
 
 
901 aa  191  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
316 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535694  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
309 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
330 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  0.990954 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  47.93 
 
 
903 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
300 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
303 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  46.06 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.66 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
306 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
301 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  39.39 
 
 
893 aa  179  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
296 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
311 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
305 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  42.18 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
304 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
304 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
306 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  39.16 
 
 
304 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
320 aa  169  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
318 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890944  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
298 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
304 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.13 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
301 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
301 aa  162  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
351 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.57 
 
 
332 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
301 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
301 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
301 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
293 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 
294 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0588577  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  37.05 
 
 
305 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  48.19 
 
 
350 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
301 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
301 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
301 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
301 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.65 
 
 
245 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.05 
 
 
304 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
301 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
310 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
334 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.27 
 
 
244 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.58 
 
 
304 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
301 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>