More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4120 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.4 
 
 
309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.21 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.33 
 
 
301 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.93 
 
 
301 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 
301 aa  323  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 
301 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 
301 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 
301 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  57.81 
 
 
301 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 
301 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  56.07 
 
 
304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.32 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.26 
 
 
301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
301 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  53 
 
 
293 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  51.67 
 
 
292 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
295 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  50.34 
 
 
291 aa  258  7e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  50.67 
 
 
292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 
298 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 
300 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 
332 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.29 
 
 
316 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.6 
 
 
299 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
309 aa  211  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 
298 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
307 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.39 
 
 
333 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
292 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
303 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
303 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
913 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
304 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
306 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  48.62 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  48.62 
 
 
303 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
287 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
287 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
309 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.62 
 
 
301 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.4 
 
 
306 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
287 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 
710 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  46.69 
 
 
292 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 
308 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
287 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
303 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
305 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
308 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.44 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
296 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
302 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.36 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
305 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.68 
 
 
286 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  43.31 
 
 
901 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 
305 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.79 
 
 
310 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
300 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.23 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.86 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  44.14 
 
 
903 aa  182  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3584  putative 3-oxo-(acyl) acyl carrier protein reductase  46.84 
 
 
305 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.53 
 
 
306 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  41.6 
 
 
305 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
301 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.6 
 
 
305 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.99 
 
 
326 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
301 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.68 
 
 
304 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.119324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13536  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.32 
 
 
317 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.721751  hitchhiker  0.00000286322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  41.13 
 
 
304 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.32 
 
 
307 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.59 
 
 
246 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.53 
 
 
246 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
300 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 
306 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
305 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
302 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
307 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
301 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
315 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>