More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2341 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 		 311 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.79 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 		 309 aa  275  5e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  53.45 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.95 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  52.82 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  53.68 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 		 351 aa  251  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.34 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.389719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3403  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 		 316 aa  229  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1440  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.48 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2162  short chain dehydrogenase  44.01 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0642494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.98 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 306 aa  214  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  44.84 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.1 
 
 		 299 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.46 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 		 304 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1567  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.97 
 
 		 306 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.25 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.857131  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 		 304 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  43.55 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0264564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.583445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  41.46 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.96 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  44.11 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.09 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  45.49 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.91 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4620  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 		 307 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4708  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.18 
 
 		 307 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5003  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR)  42.96 
 
 		 292 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.874894  normal  0.0924335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1553  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.89 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.38 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518156  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5894  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 913 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 710 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5205  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.7 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5825  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.18 
 
 		 298 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4754  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 		 276 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.011223  normal  0.184714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.6 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>