More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6895 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
301 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
306 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4360  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  59.93 
 
 
305 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51090  putative short-chain dehydrogenase  58.75 
 
 
305 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.264954  decreased coverage  0.0000000605367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.9 
 
 
334 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.59 
 
 
304 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.16 
 
 
304 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.27323  normal  0.448536 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6296  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
305 aa  354  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953973  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3902  putative short-chain dehydrogenase  63.31 
 
 
350 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3834  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.14 
 
 
303 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.23 
 
 
305 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.9 
 
 
305 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2930  putative short-chain dehydrogenase  56.91 
 
 
304 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 
304 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0854681  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.27 
 
 
301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.92 
 
 
304 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0386113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.96 
 
 
301 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
304 aa  331  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336775  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.88 
 
 
305 aa  322  7e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.707326  normal  0.647553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.83 
 
 
306 aa  296  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.973292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
317 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10149  short-chain type dehydrogenase/reductase  48.73 
 
 
286 aa  215  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0938298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.72 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
298 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0473963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
287 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
303 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
287 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
309 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
306 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  44.13 
 
 
901 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1187  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.86 
 
 
306 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1025  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.1 
 
 
303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1699  short-chain dehydrogenase  46.56 
 
 
303 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.650982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19730  oxidoreductase  46.15 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5066  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 
301 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  42.75 
 
 
893 aa  194  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4681  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 
301 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4767  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 
301 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2341  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
291 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199722  decreased coverage  0.00200779 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  41.88 
 
 
903 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2739  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
311 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5264  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13581  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0990591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
300 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
310 aa  188  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0181126  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
301 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407831  normal  0.964751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1492  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
301 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
913 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
710 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
301 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.072083  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 
309 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.555995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
301 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
302 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928177  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7556  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
310 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206699  normal  0.239691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
303 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.935758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
303 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
301 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
310 aa  178  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
295 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0301086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
326 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130256  normal  0.744191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
308 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.263864  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.24 
 
 
351 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497281  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.22 
 
 
245 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  decreased coverage  0.000184806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.53 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.49 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2741  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0205558  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 
320 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
315 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
301 aa  172  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
305 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
305 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
296 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
300 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.490724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
332 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323003  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
251 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
246 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.57 
 
 
247 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
307 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
292 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.943405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 
300 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277304  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
313 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  0.8573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>